MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me1_20_159_0.540_4.007045e-123
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.79	0.068	0.069	0.073
0.8	0.069	0.078	0.053
0.79	0.058	0.076	0.076
0.106	0.087	0.098	0.709
0.06	0.755	0.108	0.077
0.797	0.081	0.037	0.085
0.086	0.793	0.087	0.034
0.847	0.037	0.03	0.086
0.066	0.079	0.804	0.051
0.113	0.62	0.134	0.133
0.131	0.151	0.574	0.144
0.088	0.09	0.101	0.721

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me1_6_168_0.554_6.651906e-149
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.109	0.098	0.104	0.689
0.096	0.674	0.122	0.108
0.674	0.117	0.1	0.109
0.098	0.719	0.102	0.081
0.736	0.08	0.08	0.104
0.082	0.107	0.738	0.073
0.103	0.683	0.105	0.109
0.092	0.118	0.695	0.095
0.109	0.095	0.117	0.679
0.091	0.097	0.711	0.101

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me1_14_177_0.535_2.476265e-113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.768878	0.0	0.110235	0.120886
0.356859	0.0	0.103092	0.540049
0.12395	0.0	0.065679	0.810371
0.189937	0.48351	0.125618	0.200935
0.834649	0.027381	0.120182	0.017787
0.153597	0.811801	0.019264	0.015339
0.684824	0.042213	0.208052	0.064911
0.010577	0.047523	0.900627	0.041273
0.028075	0.902262	0.013926	0.055736
0.013911	0.667499	0.312627	0.005963
0.021116	0.001891	0.026838	0.950155
0.054596	0.001887	0.915183	0.028335

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_63_167_0.551_4.561192e-53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.679	0.106	0.103	0.112
0.662	0.111	0.112	0.115
0.125	0.097	0.11	0.668
0.082	0.106	0.099	0.713
0.106	0.121	0.119	0.654
0.626	0.132	0.121	0.121
0.114	0.716	0.096	0.074
0.78	0.054	0.048	0.118
0.096	0.093	0.724	0.087
0.154	0.575	0.134	0.137
0.138	0.17	0.536	0.156
0.112	0.116	0.104	0.668

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9ac_71_166_0.549_1.87519e-52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.645	0.119	0.119	0.117
0.161	0.571	0.139	0.129
0.134	0.128	0.609	0.129
0.094	0.714	0.095	0.097
0.116	0.072	0.067	0.745
0.078	0.103	0.706	0.113
0.096	0.682	0.1	0.122
0.129	0.112	0.083	0.676
0.642	0.12	0.133	0.105
0.656	0.113	0.1	0.131
0.11	0.112	0.112	0.666
0.095	0.109	0.105	0.691