MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_75_171_0.576_4.180687e-88 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.316 0.121 0.094 0.469 0.044 0.024 0.166 0.766 0.307 0.009 0.014 0.67 0.649 0.017 0.176 0.158 0.05 0.896 0.031 0.023 0.649 0.024 0.098 0.229 0.219 0.033 0.706 0.042 0.024 0.304 0.03 0.642 0.029 0.028 0.029 0.914 0.034 0.025 0.028 0.913 0.235 0.026 0.029 0.71 0.051 0.609 0.18 0.16 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_81_173_0.564_6.753456e-77 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_77_165_0.576_4.486282e-74 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.06 0.063 0.048 0.829 0.056 0.052 0.052 0.84 0.043 0.059 0.048 0.85 0.733 0.078 0.082 0.107 0.046 0.835 0.076 0.043 0.82 0.051 0.052 0.077 0.075 0.06 0.789 0.076 0.107 0.056 0.03 0.807 0.033 0.045 0.038 0.884 0.025 0.041 0.047 0.887 0.038 0.048 0.034 0.88 0.062 0.85 0.046 0.042 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_59_173_0.538_3.804893e-58 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9me3_98_178_0.510_0.001579292 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.064 0.204 0.731 0.023 0.224 0.043 0.71 0.009 0.51 0.197 0.284 0.311 0.089 0.056 0.544 0.052 0.859 0.037 0.052 0.6 0.11 0.289 0.001 0.242 0.001 0.303 0.454 0.022 0.023 0.072 0.883 0.015 0.028 0.119 0.838 0.027 0.001 0.033 0.939 0.001 0.249 0.059 0.691 0.001 0.956 0.042 0.001 MOTIF Limb_E15.5_H3K9me3_77_168_0.506_0.0002461035 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.14 0.129 0.144 0.587 0.145 0.095 0.146 0.614 0.123 0.459 0.028 0.39 0.321 0.141 0.119 0.419 0.15 0.565 0.274 0.011 0.525 0.004 0.365 0.106 0.052 0.106 0.364 0.479 0.301 0.066 0.123 0.51 0.148 0.071 0.282 0.499 0.162 0.109 0.124 0.605 0.067 0.299 0.131 0.503 0.022 0.537 0.155 0.286