MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27me3_32_168_0.515_6.747638e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.079	0.001	0.893	0.027
0.042	0.168	0.595	0.195
0.814	0.038	0.082	0.066
0.913	0.007	0.039	0.041
0.177	0.034	0.077	0.712
0.037	0.049	0.069	0.845
0.089	0.001	0.073	0.837
0.029	0.058	0.862	0.051
0.041	0.827	0.044	0.088
0.846	0.074	0.001	0.079
0.049	0.141	0.044	0.766
0.789	0.066	0.093	0.052

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_18_163_0.541_7.424981e-89
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.084	0.751	0.078	0.087
0.106	0.041	0.048	0.805
0.084	0.032	0.789	0.095
0.087	0.087	0.742	0.084
0.098	0.742	0.097	0.063
0.774	0.094	0.049	0.083
0.692	0.105	0.096	0.107
0.108	0.079	0.076	0.737
0.078	0.1	0.086	0.736
0.099	0.042	0.085	0.774
0.08	0.097	0.717	0.106
0.088	0.743	0.076	0.093

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_6_163_0.547_3.122134e-160
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.232	0.165	0.409	0.194
0.209	0.363	0.225	0.202
0.647	0.053	0.027	0.273
0.6	0.152	0.237	0.011
0.642	0.004	0.008	0.346
0.221	0.237	0.076	0.466
0.246	0.121	0.167	0.465
0.158	0.274	0.43	0.138
0.096	0.84	0.038	0.026
0.423	0.267	0.023	0.286

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_7_161_0.550_3.650496e-215
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.253	0.001	0.451	0.295
0.105	0.072	0.704	0.119
0.098	0.716	0.077	0.109
0.779	0.05	0.017	0.154
0.513	0.079	0.268	0.14
0.224	0.087	0.076	0.613
0.104	0.217	0.105	0.574
0.347	0.001	0.05	0.602
0.08	0.067	0.61	0.243
0.163	0.585	0.084	0.168
0.419	0.47	0.001	0.11
0.533	0.151	0.06	0.256

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_17_163_0.531_5.025159e-94
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.109	0.044	0.764	0.083
0.08	0.072	0.771	0.077
0.097	0.724	0.095	0.084
0.777	0.089	0.056	0.078
0.713	0.1	0.085	0.102
0.096	0.091	0.092	0.721
0.085	0.073	0.091	0.751
0.113	0.042	0.087	0.758
0.087	0.086	0.711	0.116
0.067	0.75	0.103	0.08
0.09	0.778	0.037	0.095
0.78	0.088	0.043	0.089

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_6_156_0.556_1.589384e-217
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08	0.015	0.808	0.097
0.12	0.605	0.154	0.121
0.757	0.001	0.001	0.241
0.74	0.001	0.258	0.001
0.623	0.001	0.001	0.375
0.129	0.22	0.001	0.65
0.256	0.001	0.15	0.593
0.197	0.001	0.734	0.068
0.105	0.893	0.001	0.001
0.53	0.212	0.001	0.257

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_8_156_0.549_2.88763e-128
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.001	0.928	0.07
0.12	0.633	0.159	0.088
0.653	0.066	0.001	0.28
0.789	0.001	0.209	0.001
0.591	0.001	0.001	0.407
0.004	0.273	0.001	0.722
0.305	0.001	0.149	0.545
0.188	0.078	0.635	0.099
0.068	0.93	0.001	0.001
0.492	0.244	0.001	0.262