MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me2_46_163_0.615_5.354913e-234
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.116	0.334	0.241	0.31
0.185	0.193	0.136	0.486
0.675	0.039	0.219	0.067
0.611	0.064	0.174	0.151
0.613	0.137	0.125	0.125
0.115	0.621	0.207	0.057
0.017	0.921	0.061	0.001
0.003	0.001	0.983	0.013
0.851	0.056	0.037	0.056
0.054	0.025	0.05	0.871
0.182	0.211	0.412	0.195
0.207	0.223	0.26	0.31

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_69_163_0.571_2.36273e-154
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_52_162_0.580_2.599742e-135
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9ac_32_170_0.582_4.438476e-129
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.188	0.418	0.25	0.144
0.17	0.336	0.266	0.228
0.599	0.052	0.117	0.232
0.714	0.199	0.025	0.062
0.037	0.781	0.091	0.091
0.038	0.76	0.175	0.027
0.001	0.937	0.061	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.825	0.108	0.066	0.001
0.104	0.01	0.031	0.855
0.059	0.441	0.378	0.122
0.165	0.55	0.09	0.195

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9ac_34_172_0.607_6.291755e-185
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.325	0.119	0.225	0.331
0.368	0.148	0.351	0.133
0.419	0.137	0.157	0.287
0.605	0.088	0.231	0.076
0.003	0.006	0.106	0.885
0.117	0.763	0.06	0.06
0.003	0.202	0.792	0.003
0.174	0.319	0.448	0.06
0.191	0.231	0.507	0.071
0.191	0.145	0.202	0.461
0.236	0.345	0.231	0.188
0.363	0.196	0.187	0.253

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9ac_3_157_0.676_3.23409e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.312	0.237	0.238	0.213
0.367	0.165	0.188	0.28
0.504	0.096	0.189	0.211
0.052	0.755	0.097	0.096
0.051	0.096	0.757	0.096
0.028	0.847	0.074	0.051
0.028	0.073	0.779	0.12
0.482	0.211	0.073	0.234
0.459	0.142	0.118	0.281
0.281	0.073	0.142	0.504
0.35	0.235	0.304	0.111
0.307	0.238	0.307	0.148

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_33_156_0.611_2.889064e-200
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.383	0.221	0.192	0.204
0.644	0.128	0.126	0.102
0.619	0.131	0.124	0.126
0.102	0.124	0.127	0.647
0.124	0.59	0.136	0.15
0.144	0.15	0.565	0.141
0.134	0.58	0.142	0.144
0.136	0.145	0.557	0.162
0.079	0.115	0.111	0.695
0.08	0.127	0.117	0.676
0.095	0.119	0.114	0.672
0.202	0.372	0.219	0.206