MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_43_166_0.641_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_28_161_0.654_1.699369e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.096 0.103 0.093 0.708 0.079 0.114 0.086 0.721 0.093 0.109 0.096 0.702 0.1 0.708 0.103 0.089 0.12 0.662 0.095 0.123 0.11 0.083 0.704 0.103 0.701 0.092 0.104 0.103 0.669 0.103 0.122 0.106 0.106 0.725 0.077 0.092 0.098 0.09 0.701 0.111 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_30_160_0.695_4.602407e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.142 0.12 0.136 0.602 0.076 0.147 0.09 0.687 0.153 0.138 0.146 0.563 0.127 0.58 0.133 0.16 0.17 0.598 0.09 0.142 0.099 0.121 0.631 0.149 0.599 0.144 0.159 0.098 0.529 0.165 0.157 0.149 0.133 0.623 0.132 0.112 0.123 0.14 0.586 0.151 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me3_24_156_0.661_4.044476e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.128 0.169 0.001 0.702 0.037 0.171 0.001 0.791 0.145 0.147 0.128 0.58 0.16 0.644 0.019 0.177 0.214 0.616 0.001 0.169 0.18 0.082 0.555 0.183 0.438 0.175 0.18 0.207 0.447 0.176 0.192 0.185 0.209 0.65 0.004 0.137 0.116 0.034 0.65 0.2 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_17_176_0.704_2.695819e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.268 0.146 0.336 0.25 0.251 0.561 0.183 0.005 0.269 0.003 0.723 0.005 0.189 0.266 0.192 0.353 0.267 0.002 0.231 0.5 0.089 0.515 0.004 0.392 0.236 0.002 0.758 0.004 0.26 0.188 0.111 0.44 0.512 0.123 0.187 0.178 0.568 0.119 0.297 0.016 0.344 0.289 0.197 0.17 0.318 0.229 0.293 0.16 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_28_165_0.669_7.291973e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.096 0.106 0.092 0.706 0.091 0.093 0.085 0.731 0.085 0.095 0.091 0.729 0.1 0.106 0.125 0.669 0.114 0.682 0.097 0.107 0.105 0.099 0.672 0.124 0.659 0.119 0.095 0.127 0.085 0.671 0.135 0.109 0.093 0.732 0.081 0.094 0.076 0.093 0.749 0.082 MOTIF Forebrain_P0_H3K9ac_24_151_0.627_1.519374e-298 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036 0.001 0.001 0.962 0.001 0.187 0.243 0.569 0.214 0.112 0.161 0.513 0.169 0.562 0.268 0.001 0.497 0.001 0.178 0.323 0.383 0.135 0.18 0.302 0.074 0.313 0.245 0.368 0.001 0.997 0.001 0.001 0.003 0.198 0.776 0.023 0.001 0.08 0.918 0.001