MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me1_25_163_0.537_1.630014e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.546 0.195 0.153 0.231 0.605 0.001 0.163 0.078 0.018 0.001 0.903 0.014 0.037 0.06 0.889 0.063 0.028 0.028 0.881 0.075 0.668 0.076 0.181 0.796 0.102 0.001 0.101 0.694 0.022 0.088 0.196 0.167 0.02 0.558 0.255 0.108 0.527 0.177 0.188 0.699 0.114 0.008 0.179 0.541 0.163 0.215 0.081 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me1_28_166_0.534_3.505254e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069 0.125 0.09 0.716 0.075 0.001 0.098 0.826 0.093 0.104 0.691 0.112 0.135 0.697 0.06 0.108 0.086 0.113 0.001 0.8 0.108 0.001 0.112 0.779 0.118 0.096 0.67 0.116 0.803 0.06 0.088 0.049 0.762 0.1 0.119 0.019 0.857 0.004 0.066 0.073 0.117 0.072 0.71 0.101 0.107 0.691 0.14 0.062 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me1_28_164_0.535_3.423275e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.075 0.151 0.102 0.672 0.079 0.001 0.067 0.853 0.13 0.092 0.645 0.133 0.088 0.777 0.07 0.065 0.099 0.113 0.001 0.787 0.121 0.001 0.156 0.722 0.141 0.109 0.602 0.148 0.767 0.058 0.113 0.062 0.834 0.105 0.049 0.012 0.88 0.001 0.028 0.091 0.148 0.074 0.687 0.091 0.085 0.736 0.121 0.058 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_65_165_0.554_1.216196e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.109 0.089 0.698 0.104 0.078 0.737 0.085 0.1 0.083 0.077 0.028 0.812 0.053 0.056 0.086 0.805 0.057 0.071 0.068 0.804 0.094 0.085 0.089 0.732 0.724 0.104 0.085 0.087 0.795 0.038 0.079 0.088 0.107 0.081 0.711 0.101 0.114 0.093 0.097 0.696 0.736 0.084 0.089 0.091 0.752 0.078 0.086 0.084 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me2_70_170_0.536_3.513938e-53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.101 0.088 0.71 0.101 0.087 0.716 0.09 0.107 0.09 0.075 0.04 0.795 0.065 0.079 0.082 0.774 0.063 0.083 0.065 0.789 0.111 0.094 0.077 0.718 0.746 0.096 0.078 0.08 0.81 0.033 0.067 0.09 0.12 0.084 0.709 0.087 0.114 0.701 0.106 0.079 0.791 0.077 0.048 0.084 0.741 0.083 0.095 0.081 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_69_172_0.546_1.742448e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093 0.131 0.665 0.111 0.101 0.643 0.113 0.143 0.096 0.082 0.001 0.821 0.015 0.036 0.079 0.87 0.017 0.081 0.035 0.867 0.145 0.11 0.098 0.647 0.753 0.097 0.077 0.073 0.831 0.003 0.057 0.109 0.134 0.095 0.68 0.091 0.162 0.624 0.124 0.09 0.878 0.06 0.002 0.06 0.722 0.081 0.121 0.076 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_70_170_0.536_2.392502e-59 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.103 0.089 0.728 0.091 0.051 0.083 0.775 0.086 0.107 0.693 0.114 0.088 0.727 0.071 0.114 0.077 0.077 0.03 0.816 0.059 0.063 0.086 0.792 0.113 0.073 0.081 0.733 0.737 0.093 0.081 0.089 0.764 0.088 0.079 0.069 0.804 0.04 0.073 0.083 0.113 0.077 0.716 0.094 0.097 0.718 0.083 0.102