MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_19_166_0.531_2.014569e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.867 0.048 0.059 0.026 0.857 0.075 0.066 0.002 0.744 0.05 0.114 0.092 0.158 0.462 0.189 0.191 0.12 0.141 0.607 0.132 0.055 0.707 0.123 0.115 0.061 0.852 0.006 0.081 0.144 0.072 0.012 0.772 0.06 0.74 0.127 0.073 0.071 0.092 0.029 0.808 0.002 0.242 0.131 0.625 0.067 0.05 0.061 0.822 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me1_16_162_0.539_8.85669e-116 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.793 0.089 0.079 0.039 0.711 0.163 0.123 0.003 0.739 0.019 0.098 0.144 0.131 0.214 0.574 0.081 0.692 0.078 0.02 0.21 0.078 0.087 0.817 0.018 0.053 0.629 0.275 0.043 0.106 0.836 0.038 0.02 0.147 0.53 0.058 0.265 0.154 0.194 0.014 0.638 0.036 0.187 0.164 0.613 0.078 0.166 0.122 0.634 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me1_18_161_0.533_1.312892e-66 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.731 0.075 0.148 0.046 0.577 0.189 0.232 0.002 0.752 0.079 0.091 0.078 0.403 0.027 0.358 0.212 0.017 0.03 0.909 0.044 0.033 0.362 0.565 0.04 0.058 0.905 0.032 0.005 0.056 0.047 0.032 0.865 0.06 0.334 0.175 0.431 0.011 0.21 0.042 0.737 0.007 0.241 0.251 0.501 0.066 0.073 0.125 0.736 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_14_160_0.541_5.364873e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.635 0.197 0.109 0.059 0.593 0.181 0.224 0.002 0.727 0.021 0.247 0.005 0.376 0.22 0.346 0.057 0.653 0.007 0.029 0.311 0.02 0.08 0.895 0.005 0.029 0.486 0.331 0.154 0.021 0.948 0.028 0.003 0.308 0.313 0.002 0.377 0.132 0.131 0.041 0.696 0.001 0.008 0.151 0.84 0.007 0.115 0.034 0.844 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K27ac_26_160_0.545_2.343685e-36 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.721 0.077 0.121 0.081 0.753 0.1 0.089 0.058 0.751 0.097 0.09 0.062 0.76 0.05 0.08 0.11 0.078 0.049 0.775 0.098 0.064 0.122 0.745 0.069 0.077 0.778 0.081 0.064 0.097 0.076 0.051 0.776 0.076 0.084 0.087 0.753 0.05 0.116 0.087 0.747 0.083 0.058 0.092 0.767 0.105 0.107 0.674 0.114 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27ac_24_161_0.553_4.50362e-90 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.35 0.181 0.317 0.153 0.873 0.058 0.062 0.007 0.686 0.067 0.064 0.183 0.231 0.001 0.162 0.606 0.109 0.001 0.759 0.131 0.196 0.241 0.449 0.114 0.279 0.603 0.086 0.032 0.678 0.015 0.001 0.306 0.07 0.043 0.064 0.823 0.035 0.033 0.02 0.912 0.042 0.138 0.077 0.743 0.261 0.283 0.194 0.262 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K9ac_70_173_0.538_2.471046e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.643 0.034 0.275 0.048 0.57 0.207 0.209 0.014 0.911 0.03 0.051 0.008 0.673 0.164 0.162 0.001 0.859 0.001 0.026 0.114 0.098 0.001 0.646 0.255 0.001 0.398 0.6 0.001 0.167 0.562 0.031 0.24 0.14 0.129 0.001 0.73 0.012 0.154 0.055 0.779 0.001 0.001 0.02 0.978 0.017 0.133 0.23 0.62