MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me2_53_174_0.571_5.226709e-165 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.09 0.75 0.098 0.062 0.712 0.091 0.091 0.106 0.067 0.082 0.79 0.061 0.061 0.79 0.103 0.046 0.101 0.702 0.098 0.099 0.113 0.101 0.688 0.098 0.055 0.101 0.792 0.052 0.073 0.757 0.11 0.06 0.695 0.095 0.08 0.13 0.06 0.068 0.814 0.058 0.059 0.805 0.074 0.062 0.101 0.106 0.089 0.704 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_37_164_0.605_4.490744e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.072 0.076 0.77 0.082 0.055 0.849 0.085 0.011 0.072 0.772 0.09 0.066 0.082 0.094 0.781 0.043 0.041 0.104 0.819 0.036 0.047 0.868 0.084 0.001 0.798 0.041 0.079 0.082 0.02 0.027 0.918 0.035 0.041 0.951 0.001 0.007 0.095 0.068 0.074 0.763 0.009 0.061 0.899 0.031 0.064 0.812 0.081 0.043 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_42_163_0.601_1.580615e-319 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.243 0.659 0.018 0.118 0.663 0.218 0.001 0.535 0.081 0.188 0.196 0.001 0.06 0.938 0.001 0.054 0.828 0.112 0.006 0.191 0.118 0.001 0.69 0.007 0.093 0.798 0.102 0.001 0.715 0.278 0.006 0.019 0.667 0.286 0.028 0.167 0.134 0.622 0.077 0.113 0.172 0.712 0.003 0.096 0.491 0.316 0.096 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_35_164_0.606_9.658152e-233 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067 0.323 0.54 0.07 0.124 0.701 0.158 0.017 0.395 0.12 0.346 0.138 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.098 0.193 0.001 0.708 0.001 0.277 0.614 0.108 0.001 0.752 0.246 0.001 0.094 0.725 0.142 0.039 0.276 0.093 0.491 0.14 0.038 0.04 0.921 0.001 0.098 0.81 0.091 0.001 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9ac_43_177_0.565_1.337427e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.152 0.038 0.782 0.028 0.172 0.652 0.126 0.05 0.691 0.116 0.039 0.154 0.139 0.023 0.753 0.085 0.122 0.49 0.244 0.144 0.043 0.616 0.17 0.171 0.187 0.045 0.168 0.6 0.02 0.228 0.571 0.181 0.055 0.703 0.094 0.148 0.235 0.321 0.226 0.219 MOTIF Forebrain_P0_H3K9ac_52_171_0.575_5.965752e-104 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.323 0.385 0.205 0.088 0.488 0.131 0.257 0.124 0.023 0.032 0.925 0.02 0.178 0.609 0.2 0.013 0.573 0.135 0.023 0.269 0.002 0.209 0.756 0.033 0.064 0.673 0.259 0.004 0.139 0.638 0.038 0.185 0.091 0.068 0.615 0.226 0.011 0.351 0.548 0.09 0.056 0.77 0.054 0.12 0.276 0.158 0.079 0.487 MOTIF Midbrain_P0_H3K9ac_61_174_0.552_1.521078e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.412 0.442 0.13 0.016 0.714 0.028 0.225 0.033 0.025 0.036 0.918 0.021 0.037 0.924 0.018 0.021 0.5 0.028 0.024 0.449 0.027 0.147 0.805 0.021 0.03 0.74 0.199 0.031 0.032 0.62 0.153 0.195 0.048 0.095 0.428 0.429 0.027 0.227 0.716 0.03 0.027 0.703 0.044 0.226 0.131 0.211 0.147 0.511