MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me1_3_153_0.563_2.226571e-269 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.033 0.23 0.602 0.135 0.299 0.185 0.104 0.412 0.656 0.058 0.24 0.046 0.944 0.04 0.015 0.001 0.939 0.001 0.001 0.059 0.001 0.928 0.012 0.059 0.997 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 0.001 0.845 0.001 0.001 0.153 0.228 0.017 0.75 0.005 0.012 0.096 0.891 0.001 0.086 0.654 0.259 0.001 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me1_11_154_0.541_6.420573e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.016 0.458 0.416 0.11 0.08 0.749 0.054 0.117 0.248 0.033 0.01 0.709 0.007 0.038 0.047 0.908 0.005 0.007 0.003 0.985 0.014 0.037 0.946 0.003 0.078 0.018 0.008 0.896 0.045 0.221 0.057 0.677 0.154 0.077 0.028 0.741 0.172 0.174 0.352 0.302 0.253 0.672 0.038 0.037 0.437 0.265 0.015 0.284 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me1_25_156_0.533_3.082399e-85 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.686 0.247 0.066 0.204 0.612 0.094 0.09 0.117 0.08 0.032 0.771 0.001 0.001 0.045 0.953 0.011 0.028 0.013 0.948 0.073 0.001 0.925 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.098 0.101 0.061 0.74 0.051 0.172 0.021 0.756 0.06 0.207 0.122 0.611 0.048 0.865 0.049 0.038 0.504 0.31 0.026 0.16 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me1_19_167_0.537_1.348686e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.233 0.397 0.182 0.188 0.139 0.278 0.498 0.086 0.048 0.822 0.052 0.078 0.046 0.054 0.001 0.899 0.009 0.117 0.082 0.792 0.001 0.001 0.002 0.996 0.024 0.019 0.956 0.001 0.124 0.162 0.014 0.7 0.004 0.007 0.027 0.962 0.081 0.04 0.021 0.858 0.448 0.124 0.191 0.236 0.203 0.623 0.063 0.111 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me1_13_162_0.535_1.72765e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.109 0.728 0.069 0.116 0.659 0.086 0.139 0.119 0.085 0.006 0.79 0.013 0.194 0.176 0.617 0.054 0.024 0.073 0.849 0.061 0.111 0.787 0.041 0.109 0.127 0.047 0.717 0.031 0.008 0.064 0.897 0.027 0.025 0.021 0.927 0.134 0.141 0.121 0.604 0.107 0.73 0.084 0.079 0.613 0.206 0.021 0.16 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me1_26_161_0.534_5.266481e-84 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.177 0.347 0.432 0.044 0.038 0.419 0.486 0.057 0.067 0.773 0.059 0.101 0.087 0.041 0.02 0.852 0.03 0.084 0.087 0.799 0.03 0.033 0.026 0.911 0.061 0.074 0.817 0.048 0.055 0.064 0.034 0.847 0.05 0.082 0.073 0.795 0.083 0.025 0.034 0.858 0.081 0.096 0.694 0.129 0.071 0.792 0.06 0.077 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me1_20_163_0.533_5.066001e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.145 0.548 0.153 0.154 0.133 0.149 0.582 0.136 0.103 0.677 0.102 0.118 0.11 0.104 0.067 0.719 0.075 0.123 0.125 0.677 0.09 0.084 0.099 0.727 0.104 0.128 0.66 0.108 0.108 0.12 0.085 0.687 0.094 0.124 0.112 0.67 0.109 0.067 0.089 0.735 0.103 0.119 0.637 0.141 0.106 0.678 0.1 0.116 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me1_17_161_0.533_9.245321e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.084 0.733 0.092 0.083 0.733 0.088 0.096 0.096 0.081 0.041 0.782 0.065 0.092 0.118 0.725 0.067 0.053 0.085 0.795 0.081 0.114 0.711 0.094 0.083 0.085 0.062 0.77 0.074 0.083 0.093 0.75 0.077 0.036 0.088 0.799 0.111 0.107 0.692 0.09 0.106 0.731 0.086 0.077 0.778 0.086 0.044 0.092