MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me1_27_165_0.526_1.979367e-33
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.541	0.162	0.296
0.181	0.001	0.001	0.817
0.065	0.003	0.583	0.349
0.313	0.282	0.338	0.066
0.469	0.51	0.002	0.019
0.982	0.001	0.001	0.016
0.078	0.001	0.693	0.228
0.001	0.975	0.001	0.023
0.096	0.001	0.001	0.902
0.001	0.022	0.733	0.244
0.177	0.227	0.404	0.192
0.244	0.449	0.188	0.118

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me1_11_153_0.556_4.419892e-210
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.212	0.391	0.153	0.245
0.22	0.016	0.003	0.761
0.064	0.04	0.818	0.078
0.21	0.483	0.254	0.053
0.056	0.942	0.001	0.001
0.986	0.001	0.001	0.012
0.153	0.001	0.646	0.2
0.251	0.723	0.001	0.025
0.107	0.016	0.001	0.876
0.013	0.044	0.776	0.167
0.067	0.318	0.377	0.238
0.132	0.439	0.111	0.318

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_12_160_0.544_6.805128e-130
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.173	0.153	0.5	0.174
0.276	0.353	0.31	0.061
0.258	0.616	0.049	0.077
0.787	0.013	0.02	0.18
0.074	0.007	0.818	0.101
0.121	0.799	0.018	0.062
0.087	0.016	0.001	0.896
0.004	0.057	0.848	0.091
0.086	0.354	0.302	0.258
0.101	0.808	0.064	0.027
0.69	0.02	0.009	0.281
0.259	0.093	0.563	0.085

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me1_5_153_0.541_3.781783e-97
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.275	0.145	0.362	0.218
0.37	0.344	0.224	0.062
0.179	0.819	0.001	0.001
0.918	0.001	0.001	0.08
0.001	0.001	0.88	0.118
0.154	0.745	0.001	0.1
0.136	0.001	0.001	0.862
0.001	0.001	0.878	0.12
0.141	0.29	0.274	0.294
0.235	0.516	0.001	0.248
0.48	0.001	0.011	0.508
0.277	0.153	0.282	0.288

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me1_9_157_0.533_2.569625e-70
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.292	0.165	0.113	0.429
0.289	0.102	0.223	0.387
0.399	0.137	0.227	0.237
0.577	0.118	0.25	0.055
0.35	0.42	0.134	0.095
0.805	0.001	0.001	0.193
0.24	0.093	0.591	0.076
0.013	0.932	0.001	0.054
0.301	0.001	0.001	0.697
0.051	0.152	0.699	0.098
0.068	0.427	0.157	0.347
0.268	0.281	0.009	0.443

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me1_10_160_0.543_6.406514e-82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.249	0.055	0.402	0.293
0.213	0.225	0.401	0.16
0.199	0.672	0.105	0.024
0.534	0.001	0.001	0.464
0.048	0.122	0.71	0.12
0.157	0.528	0.126	0.189
0.29	0.008	0.001	0.701
0.029	0.057	0.471	0.443
0.226	0.111	0.23	0.433
0.352	0.202	0.232	0.215
0.602	0.137	0.13	0.131
0.471	0.106	0.227	0.196

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me1_6_155_0.548_1.733167e-178
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.231	0.078	0.451	0.239
0.19	0.181	0.47	0.159
0.208	0.502	0.216	0.074
0.553	0.063	0.062	0.322
0.141	0.095	0.62	0.144
0.166	0.509	0.098	0.227
0.193	0.062	0.062	0.683
0.002	0.002	0.418	0.578
0.123	0.107	0.185	0.585
0.482	0.113	0.146	0.26
0.741	0.095	0.067	0.097
0.64	0.097	0.083	0.18

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_19_162_0.531_2.410831e-51
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111	0.113	0.109	0.667
0.096	0.112	0.111	0.681
0.123	0.125	0.122	0.63
0.607	0.134	0.128	0.131
0.13	0.667	0.102	0.101
0.723	0.074	0.074	0.129
0.108	0.105	0.672	0.115
0.11	0.683	0.095	0.112
0.139	0.077	0.073	0.711
0.095	0.116	0.66	0.129
0.115	0.638	0.125	0.122
0.127	0.658	0.087	0.128