MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_32_166_0.666_2.535612e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.145	0.147	0.5	0.209
0.123	0.625	0.133	0.119
0.157	0.127	0.551	0.165
0.045	0.123	0.731	0.101
0.055	0.65	0.152	0.143
0.063	0.175	0.139	0.623
0.057	0.204	0.203	0.536
0.03	0.694	0.119	0.157
0.128	0.525	0.137	0.21
0.144	0.163	0.49	0.202
0.122	0.186	0.169	0.523
0.138	0.201	0.212	0.448

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me3_52_171_0.598_1.097397e-157
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024	0.048	0.85	0.078
0.073	0.813	0.053	0.061
0.114	0.082	0.742	0.062
0.043	0.033	0.872	0.052
0.023	0.915	0.039	0.023
0.026	0.025	0.045	0.904
0.025	0.065	0.063	0.847
0.018	0.942	0.023	0.017
0.067	0.76	0.038	0.135
0.058	0.067	0.775	0.1
0.051	0.095	0.095	0.759
0.077	0.061	0.037	0.825

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me2_75_118_0.530_3.136786e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	1.0	0.0	0.0
0.042323	0.0184	0.558561	0.380716
0.0	0.0421	0.767499	0.190401
0.0	0.903724	0.041399	0.054877
0.075754	0.022225	0.039981	0.86204
0.00348	0.0	0.045717	0.950803
0.0	0.722504	0.0	0.277496
0.012299	0.905131	0.036156	0.046413
0.190949	0.76327	0.017451	0.028331

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me2_74_105_0.551_1.84738e-110
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.903591	0.023662	0.072747
0.067559	0.038958	0.799353	0.09413
0.0	0.076738	0.875175	0.048087
0.026097	0.685942	0.046237	0.241723
0.082543	0.006187	0.015419	0.895851
0.0	0.022408	0.049197	0.928395
0.0	0.686713	0.0	0.313287
0.040085	0.903051	0.0	0.056864
0.035023	0.70813	0.009517	0.247331
0.035413	0.627063	0.165029	0.172495

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me2_76_105_0.544_2.793724e-73
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.149793	0.0	0.79391	0.056297
0.0	0.613962	0.0	0.386038
0.0	0.03115	0.885396	0.083454
0.009296	0.062726	0.866023	0.061955
0.0198	0.776981	0.016477	0.186742
0.004169	0.0	0.055965	0.939866
0.071861	0.0	0.0	0.928139
0.0	0.940506	0.0	0.059494
0.027648	0.946208	0.026145	0.0

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me2_60_85_0.563_2.996408e-152
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029887	0.016201	0.785641	0.168271
0.026016	0.738216	0.0	0.235768
0.055889	0.056057	0.795139	0.092914
0.118368	0.033976	0.67319	0.174467
0.0	0.758965	0.017461	0.223573
0.008636	0.095058	0.057787	0.838518
0.111535	0.07441	0.0	0.814054
0.0	0.979149	0.0	0.020851
0.017022	0.901732	0.043979	0.037267

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me2_65_77_0.565_6.725377e-155
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.076384	0.702764	0.081808	0.139044
0.026071	0.037563	0.705763	0.230602
0.012748	0.684835	0.017596	0.284821
0.061528	0.023753	0.899702	0.015018
0.025541	0.057155	0.782959	0.134345
0.021134	0.644477	0.040795	0.293594
0.006807	0.013535	0.017135	0.962524
0.007098	0.043253	0.040387	0.909263
0.0	0.958889	0.0	0.041111
0.0	0.930623	0.0	0.069377

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9ac_48_75_0.580_1.118779e-97
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026108	0.0	0.960485	0.013407
0.090198	0.835356	0.0	0.074445
0.211937	0.049274	0.707537	0.031252
0.152253	0.031661	0.492032	0.324054
0.014511	0.888715	0.043478	0.053295
0.042886	0.032041	0.123018	0.802054
0.007057	0.049851	0.036196	0.906895
0.0	0.992165	0.0	0.007835
0.008754	0.946866	0.022696	0.021685