MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K36me3_114_159_0.504_3.241384e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.058	0.032	0.025	0.885
0.087	0.039	0.808	0.066
0.04	0.036	0.058	0.866
0.023	0.033	0.063	0.881
0.017	0.081	0.004	0.898
0.059	0.065	0.108	0.768
0.774	0.072	0.048	0.106
0.844	0.051	0.043	0.062
0.881	0.013	0.058	0.048
0.088	0.089	0.755	0.068
0.071	0.048	0.046	0.835
0.81	0.052	0.094	0.044

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me2_53_161_0.540_2.230177e-62
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.659	0.083	0.096	0.162
0.726	0.055	0.194	0.025
0.737	0.069	0.184	0.01
0.016	0.836	0.127	0.021
0.01	0.117	0.012	0.861
0.027	0.148	0.026	0.799
0.157	0.01	0.132	0.701
0.733	0.104	0.027	0.136
0.745	0.063	0.096	0.096
0.869	0.008	0.102	0.021
0.132	0.099	0.672	0.097
0.137	0.15	0.02	0.693

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_56_173_0.570_1.343695e-161
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.042	0.014	0.943
0.001	0.053	0.033	0.913
0.039	0.001	0.125	0.835
0.717	0.089	0.08	0.114
0.982	0.001	0.016	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001
0.001	0.046	0.952	0.001
0.001	0.069	0.169	0.761

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_56_169_0.613_7.448633e-164
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.035	0.024	0.94
0.001	0.026	0.001	0.972
0.075	0.001	0.069	0.855
0.864	0.052	0.001	0.083
0.997	0.001	0.001	0.001
0.98	0.018	0.001	0.001
0.131	0.085	0.717	0.067
0.001	0.085	0.099	0.815

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_81_170_0.562_1.41737e-92
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.263	0.388	0.021	0.328
0.383	0.067	0.39	0.16
0.001	0.878	0.12	0.001
0.146	0.001	0.048	0.805
0.003	0.001	0.128	0.868
0.115	0.079	0.016	0.79
0.764	0.141	0.016	0.079
0.997	0.001	0.001	0.001
0.858	0.093	0.048	0.001
0.058	0.305	0.595	0.042

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me3_66_164_0.578_9.664036e-143
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me3_55_165_0.596_1.337622e-158
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.323	0.171	0.239	0.266
0.261	0.46	0.123	0.156
0.001	0.094	0.001	0.904
0.001	0.005	0.005	0.989
0.017	0.001	0.217	0.765
0.691	0.176	0.009	0.124
0.997	0.001	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001
0.223	0.147	0.481	0.149
0.016	0.289	0.008	0.687
0.185	0.109	0.118	0.588
0.234	0.305	0.197	0.264

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_70_166_0.571_1.683307e-130
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me3_61_163_0.571_8.324963e-96
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036	0.252	0.659	0.053
0.029	0.062	0.011	0.898
0.059	0.074	0.021	0.846
0.078	0.08	0.041	0.801
0.567	0.034	0.125	0.274
0.777	0.094	0.1	0.029
0.808	0.014	0.093	0.085
0.091	0.218	0.63	0.061
0.114	0.058	0.055	0.773
0.066	0.02	0.12	0.794
0.063	0.024	0.078	0.835
0.775	0.048	0.056	0.121