MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Limb_E15.5_H3K27me3_34_167_0.517_1.768072e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.724 0.094 0.07 0.112 0.083 0.071 0.081 0.765 0.098 0.082 0.093 0.727 0.082 0.727 0.089 0.102 0.768 0.088 0.033 0.111 0.091 0.069 0.075 0.765 0.081 0.092 0.078 0.749 0.093 0.083 0.068 0.756 0.1 0.04 0.078 0.782 0.087 0.092 0.715 0.106 0.096 0.735 0.08 0.089 0.788 0.088 0.029 0.095 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27me3_53_151_0.506_8.924364e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.022 0.062 0.816 0.05 0.027 0.805 0.118 0.042 0.825 0.078 0.055 0.838 0.037 0.023 0.102 0.873 0.05 0.049 0.028 0.921 0.029 0.038 0.012 0.812 0.06 0.084 0.044 0.098 0.021 0.046 0.835 0.082 0.044 0.828 0.046 0.832 0.037 0.081 0.05 0.832 0.025 0.041 0.102 0.093 0.057 0.786 0.064 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me2_69_171_0.560_1.706947e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.221 0.514 0.096 0.169 0.207 0.036 0.037 0.72 0.09 0.072 0.658 0.18 0.237 0.49 0.169 0.103 0.603 0.1 0.032 0.265 0.308 0.134 0.204 0.354 0.631 0.107 0.084 0.178 0.644 0.114 0.077 0.165 0.238 0.047 0.057 0.658 0.176 0.052 0.154 0.618 0.575 0.163 0.095 0.167 0.676 0.11 0.084 0.13 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_76_161_0.545_4.332081e-72 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.722 0.08 0.098 0.095 0.03 0.041 0.834 0.073 0.066 0.764 0.097 0.118 0.714 0.084 0.084 0.783 0.07 0.037 0.11 0.126 0.091 0.119 0.664 0.738 0.09 0.074 0.098 0.733 0.073 0.089 0.105 0.109 0.065 0.068 0.758 0.102 0.063 0.082 0.753 0.736 0.081 0.076 0.107 0.799 0.062 0.062 0.077 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_67_163_0.561_8.152353e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.001 0.981 0.017 0.217 0.675 0.1 0.008 0.701 0.07 0.001 0.228 0.06 0.169 0.226 0.545 0.737 0.001 0.102 0.16 0.747 0.09 0.001 0.162 0.035 0.001 0.001 0.963 0.121 0.006 0.192 0.681 0.456 0.25 0.067 0.227 0.82 0.094 0.072 0.014 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_61_163_0.568_1.106515e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077 0.045 0.063 0.815 0.05 0.042 0.827 0.081 0.075 0.798 0.039 0.088 0.791 0.059 0.063 0.087 0.789 0.068 0.076 0.067 0.826 0.058 0.051 0.065 0.809 0.059 0.072 0.06 0.069 0.087 0.031 0.813 0.085 0.093 0.092 0.73 0.801 0.056 0.066 0.077 MOTIF Lung_E16.5_H3K9ac_59_173_0.554_1.036797e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.854 0.001 0.056 0.089 0.001 0.052 0.038 0.909 0.038 0.001 0.001 0.96 0.001 0.044 0.019 0.936 0.07 0.034 0.032 0.864 0.05 0.168 0.666 0.116 0.06 0.885 0.001 0.054 0.968 0.001 0.001 0.03 MOTIF Midbrain_P0_H3K9ac_53_175_0.565_1.666282e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.119 0.001 0.124 0.756 0.025 0.082 0.704 0.189 0.162 0.648 0.051 0.139 0.657 0.031 0.117 0.195 0.64 0.032 0.196 0.132 0.959 0.001 0.039 0.001 0.982 0.001 0.001 0.016 0.183 0.075 0.089 0.653 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_63_172_0.565_1.615585e-91 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.745 0.074 0.097 0.084 0.798 0.045 0.056 0.101 0.066 0.047 0.052 0.835 0.039 0.059 0.06 0.842 0.089 0.1 0.059 0.752 0.062 0.062 0.038 0.838 0.096 0.037 0.809 0.058 0.104 0.71 0.07 0.116 0.848 0.06 0.032 0.06 0.823 0.057 0.065 0.055