MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Lung_E15.5_H3K27me3_31_161_0.524_5.601846e-11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.042 0.071 0.074 0.813 0.083 0.031 0.055 0.831 0.096 0.094 0.1 0.71 0.7 0.095 0.115 0.09 0.772 0.118 0.055 0.055 0.818 0.039 0.055 0.088 0.094 0.091 0.729 0.086 0.092 0.79 0.049 0.069 0.11 0.107 0.084 0.699 0.081 0.123 0.704 0.092 0.083 0.716 0.088 0.113 0.098 0.1 0.086 0.716 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me2_64_156_0.554_4.774169e-88 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.208 0.144 0.362 0.286 0.183 0.366 0.18 0.271 0.175 0.076 0.22 0.529 0.078 0.279 0.573 0.07 0.141 0.671 0.076 0.112 0.278 0.062 0.014 0.646 0.164 0.063 0.252 0.521 0.099 0.059 0.198 0.644 0.423 0.194 0.268 0.116 0.818 0.081 0.053 0.048 0.737 0.049 0.156 0.058 0.574 0.062 0.213 0.151 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_53_160_0.571_1.00787e-142 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me2_57_164_0.572_1.70268e-132 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me2_41_159_0.584_1.365672e-229 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_57_164_0.576_1.17144e-180 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me2_57_169_0.575_2.853983e-161 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_60_166_0.576_7.282955e-140 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_57_163_0.582_9.755778e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.678 0.091 0.113 0.118 0.12 0.109 0.668 0.103 0.142 0.606 0.126 0.126 0.157 0.093 0.603 0.147 0.118 0.112 0.664 0.106 0.643 0.126 0.108 0.123 0.12 0.096 0.114 0.67 0.089 0.095 0.106 0.71 0.108 0.109 0.114 0.669 0.666 0.103 0.116 0.115 0.717 0.096 0.104 0.083 0.706 0.091 0.102 0.101