MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_22_162_0.693_1.215911e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.269	0.251	0.273	0.207
0.133	0.609	0.143	0.115
0.127	0.123	0.613	0.137
0.086	0.141	0.677	0.096
0.13	0.628	0.128	0.114
0.125	0.112	0.634	0.129
0.111	0.104	0.676	0.109
0.097	0.143	0.641	0.119
0.103	0.143	0.141	0.613
0.079	0.136	0.129	0.656
0.078	0.137	0.136	0.649
0.17	0.252	0.241	0.337

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me3_29_164_0.655_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me3_29_166_0.649_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_41_165_0.651_4.730441e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.731	0.083	0.114	0.072
0.076	0.071	0.801	0.052
0.098	0.736	0.083	0.083
0.106	0.104	0.696	0.094
0.052	0.097	0.791	0.06
0.107	0.724	0.089	0.08
0.092	0.093	0.724	0.091
0.058	0.085	0.787	0.07
0.067	0.754	0.1	0.079
0.062	0.095	0.076	0.767
0.048	0.099	0.098	0.755
0.066	0.111	0.092	0.731

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me3_13_158_0.686_4.952238e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.757	0.089	0.071	0.083
0.801	0.099	0.044	0.056
0.781	0.08	0.082	0.057
0.027	0.837	0.076	0.06
0.115	0.739	0.032	0.114
0.063	0.066	0.808	0.063
0.052	0.802	0.094	0.052
0.072	0.825	0.031	0.072
0.035	0.06	0.84	0.065
0.065	0.812	0.061	0.062

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_6_155_0.737_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.593	0.14	0.155	0.112
0.61	0.139	0.127	0.124
0.572	0.136	0.148	0.144
0.141	0.533	0.163	0.163
0.147	0.674	0.023	0.156
0.114	0.104	0.642	0.14
0.122	0.593	0.155	0.13
0.133	0.559	0.174	0.134
0.112	0.119	0.645	0.124
0.14	0.578	0.156	0.126

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_33_161_0.581_1.300294e-226
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_3_154_0.639_3.687311e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.755	0.093	0.102	0.05
0.826	0.068	0.1	0.006
0.617	0.172	0.137	0.074
0.236	0.248	0.382	0.135
0.074	0.88	0.032	0.014
0.139	0.079	0.659	0.123
0.108	0.582	0.197	0.113
0.136	0.604	0.184	0.076
0.001	0.001	0.992	0.006
0.059	0.665	0.264	0.012

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_3_160_0.653_4.025061e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.584	0.144	0.143	0.129
0.597	0.14	0.146	0.117
0.57	0.14	0.147	0.143
0.152	0.562	0.153	0.133
0.131	0.616	0.133	0.12
0.118	0.123	0.629	0.13
0.13	0.604	0.143	0.123
0.134	0.601	0.14	0.125
0.11	0.135	0.637	0.118
0.129	0.6	0.144	0.127