MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me1_15_165_0.548_1.227354e-122 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.293 0.243 0.252 0.211 0.169 0.515 0.161 0.155 0.179 0.099 0.542 0.18 0.105 0.119 0.659 0.117 0.104 0.693 0.107 0.096 0.15 0.05 0.077 0.723 0.086 0.104 0.716 0.094 0.643 0.119 0.134 0.104 0.635 0.138 0.145 0.082 0.63 0.132 0.126 0.112 0.141 0.111 0.147 0.601 0.191 0.242 0.351 0.215 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me1_8_169_0.547_2.126672e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.207 0.358 0.205 0.23 0.181 0.231 0.386 0.203 0.06 0.566 0.145 0.229 0.368 0.001 0.012 0.619 0.178 0.102 0.642 0.078 0.626 0.126 0.238 0.01 0.602 0.283 0.106 0.009 0.932 0.015 0.025 0.028 0.12 0.095 0.614 0.171 0.073 0.538 0.29 0.099 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me1_3_155_0.563_3.311406e-94 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.13 0.078 0.688 0.104 0.037 0.204 0.702 0.057 0.062 0.847 0.055 0.036 0.023 0.02 0.025 0.932 0.022 0.073 0.817 0.088 0.275 0.249 0.024 0.452 0.307 0.118 0.03 0.545 0.405 0.181 0.08 0.335 0.366 0.34 0.1 0.194 0.229 0.201 0.398 0.172 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me1_16_162_0.539_3.434111e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133 0.137 0.181 0.549 0.171 0.163 0.111 0.555 0.003 0.081 0.008 0.908 0.115 0.321 0.354 0.209 0.374 0.283 0.151 0.192 0.106 0.579 0.197 0.118 0.652 0.113 0.092 0.143 0.092 0.245 0.571 0.092 0.217 0.533 0.068 0.182 0.154 0.249 0.361 0.236 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me1_8_164_0.547_1.526319e-176 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.239 0.315 0.25 0.197 0.135 0.118 0.575 0.172 0.045 0.765 0.074 0.116 0.105 0.035 0.033 0.827 0.089 0.094 0.689 0.128 0.236 0.149 0.096 0.519 0.163 0.505 0.171 0.161 0.839 0.017 0.035 0.109 0.595 0.114 0.243 0.048 0.577 0.106 0.173 0.144 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me1_8_155_0.548_2.181857e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.199 0.427 0.241 0.134 0.071 0.114 0.704 0.111 0.074 0.702 0.113 0.111 0.134 0.006 0.05 0.81 0.087 0.104 0.546 0.263 0.233 0.228 0.098 0.441 0.213 0.438 0.168 0.18 0.8 0.062 0.045 0.093 0.603 0.1 0.214 0.083 0.586 0.088 0.165 0.161 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_6_162_0.551_4.799006e-206 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.305 0.009 0.053 0.633 0.028 0.02 0.033 0.919 0.095 0.198 0.149 0.558 0.384 0.22 0.185 0.211 0.204 0.541 0.124 0.131 0.59 0.046 0.033 0.331 0.128 0.111 0.642 0.119 0.148 0.596 0.143 0.113 0.269 0.382 0.102 0.247 0.176 0.196 0.392 0.236 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me2_58_173_0.543_1.034391e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me2_56_173_0.543_2.929071e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7