MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27me3_30_176_0.520_1.320296e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.112	0.709	0.094	0.085
0.098	0.09	0.713	0.099
0.088	0.755	0.065	0.092
0.064	0.073	0.067	0.796
0.059	0.093	0.097	0.751
0.051	0.098	0.094	0.757
0.048	0.788	0.073	0.091
0.064	0.114	0.05	0.772
0.066	0.103	0.094	0.737
0.078	0.067	0.082	0.773
0.095	0.092	0.715	0.098
0.089	0.733	0.095	0.083

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_58_168_0.575_1.238716e-155
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me2_10_153_0.634_1.055166e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.842	0.088	0.051	0.019
0.641	0.122	0.145	0.092
0.204	0.171	0.3	0.325
0.151	0.15	0.565	0.134
0.537	0.244	0.218	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001
0.652	0.029	0.281	0.038
0.173	0.351	0.221	0.255
0.001	0.987	0.011	0.001
0.001	0.001	0.955	0.043

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me2_62_172_0.568_2.446698e-148
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Limb_E15.5_H3K4me2_25_154_0.624_5.734918e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.652	0.03	0.141	0.177
0.536	0.137	0.162	0.165
0.199	0.15	0.19	0.46
0.186	0.186	0.519	0.109
0.601	0.12	0.117	0.162
0.705	0.051	0.138	0.106
0.627	0.139	0.15	0.084
0.126	0.535	0.167	0.172
0.072	0.671	0.138	0.119
0.089	0.08	0.711	0.12

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_68_167_0.554_6.955098e-110
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.7	0.1	0.1	0.1

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9ac_9_151_0.627_2.884896e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056	0.844	0.036	0.064
0.043	0.07	0.864	0.023
0.138	0.309	0.325	0.228
0.108	0.191	0.176	0.525
0.001	0.006	0.037	0.956
0.041	0.265	0.192	0.502
0.124	0.499	0.145	0.232
0.136	0.229	0.387	0.248
0.083	0.26	0.251	0.406
0.246	0.147	0.14	0.467

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_10_154_0.603_4.530991e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.996	0.001	0.002
0.001	0.001	0.997	0.001
0.084	0.41	0.239	0.267
0.058	0.154	0.081	0.707
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.264	0.134	0.601
0.016	0.57	0.088	0.326
0.187	0.178	0.378	0.257
0.079	0.2	0.109	0.612
0.161	0.119	0.038	0.682

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_58_167_0.574_1.371464e-100
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1