MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me1_102_46_0.501_2.596027e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.284978	0.154117	0.365348	0.195557
0.040472	0.55365	0.402473	0.003406
0.956612	0.024163	0.005376	0.013849
0.032755	0.083666	0.859308	0.024271
0.850024	0.072944	0.042695	0.034337
0.031082	0.09815	0.757748	0.113019
0.092715	0.188423	0.664885	0.053978
0.053714	0.11109	0.822824	0.012371
0.78057	0.162855	0.030601	0.025974
0.179197	0.10231	0.699404	0.019089
0.014937	0.059475	0.908533	0.017055

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me1_86_68_0.505_4.32863e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.848736	0.008677	0.119679	0.022908
0.172397	0.056523	0.77108	0.0
0.823758	0.022699	0.054697	0.098847
0.038918	0.017001	0.889695	0.054386
0.123451	0.053177	0.812105	0.011267
0.080807	0.069977	0.828559	0.020658
0.82151	0.124185	0.036769	0.017536
0.318618	0.041543	0.495409	0.14443
0.0	0.015793	0.971388	0.012819

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me1_78_68_0.510_5.868075e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021538	0.370945	0.330122	0.277395
0.07135	0.076283	0.820867	0.0315
0.049134	0.862792	0.060407	0.027667
0.802019	0.147142	0.020853	0.029987
0.099621	0.297754	0.602625	0.0
0.789694	0.026264	0.034467	0.149574
0.0	0.023686	0.834537	0.141777
0.005546	0.017962	0.909767	0.066725
0.06635	0.046467	0.795172	0.092011
0.796246	0.077359	0.056929	0.069465
0.416122	0.14663	0.177273	0.259975

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me1_91_99_0.506_5.996858e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069465	0.006066	0.865888	0.058581
0.035773	0.898573	0.062541	0.003113
0.718074	0.064337	0.023331	0.194258
0.138522	0.052515	0.805547	0.003415
0.856441	0.031806	0.029333	0.08242
0.032362	0.020216	0.81769	0.129731
0.269135	0.009652	0.701662	0.01955
0.04059	0.040649	0.869774	0.048987
0.767742	0.183334	0.031668	0.017257
0.631204	0.108667	0.099559	0.16057
0.015716	0.462662	0.521622	0.0

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_68_83_0.515_1.887956e-27
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043237	0.060356	0.854263	0.042144
0.01342	0.887925	0.073694	0.024961
0.898095	0.031476	0.015804	0.054626
0.039392	0.054455	0.904934	0.00122
0.826139	0.037579	0.032134	0.104148
0.042032	0.011145	0.821641	0.125182
0.088694	0.013311	0.812886	0.085109
0.212674	0.075861	0.637229	0.074236
0.707983	0.151947	0.126476	0.013594
0.346832	0.245259	0.407909	0.0
0.089624	0.29354	0.449327	0.16751

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me1_99_99_0.503_0.0001909315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.159519	0.066359	0.736662	0.03746
0.101183	0.884733	0.003237	0.010847
0.787159	0.143071	0.010988	0.058782
0.024898	0.135925	0.829436	0.009741
0.825613	0.040074	0.028939	0.105374
0.016302	0.013978	0.959865	0.009855
0.080011	0.047942	0.65595	0.216097
0.068011	0.033463	0.860642	0.037885
0.874394	0.035178	0.069374	0.021054
0.368176	0.496792	0.127476	0.007556

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me2_78_99_0.508_1.639745e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003953	0.707193	0.09244	0.196413
0.101126	0.07828	0.070885	0.74971
0.013102	0.701764	0.081018	0.204116
0.02572	0.830236	0.124971	0.019073
0.097594	0.744569	0.143604	0.014233
0.021962	0.052375	0.08705	0.838613
0.001028	0.784631	0.072118	0.142222
0.020773	0.05358	0.025891	0.899755
0.000997	0.965975	0.019744	0.013284

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_82_97_0.514_8.171142e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.814927	0.106599	0.044314	0.034159
0.091969	0.195517	0.70616	0.006354
0.689898	0.173439	0.051832	0.084831
0.017497	0.118029	0.822923	0.041551
0.046629	0.13832	0.793876	0.021175
0.090382	0.098671	0.80035	0.010597
0.84143	0.090521	0.027609	0.04044
0.127852	0.016557	0.838339	0.017253
0.04461	0.050088	0.886025	0.019278

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_98_91_0.505_8.717541e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087857	0.534479	0.150911	0.226753
0.014561	0.86996	0.066019	0.04946
0.00973	0.720718	0.135057	0.134494
0.049152	0.012042	0.030938	0.907868
0.027171	0.796472	0.046892	0.129465
0.050559	0.867142	0.048149	0.034149
0.010911	0.8033	0.167429	0.018359
0.060998	0.033895	0.077137	0.827971
0.015883	0.882869	0.068232	0.033016
0.037024	0.030982	0.067844	0.86415
0.0	0.648088	0.345126	0.006786
0.0	0.313976	0.284686	0.401338