MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_34_12_0.617_7.220769e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.058201 0.777279 0.133219 0.031302 0.017773 0.687981 0.250842 0.043404 0.007084 0.911419 0.051516 0.02998 0.762983 0.074948 0.062138 0.099931 0.010228 0.743595 0.12576 0.120416 0.035049 0.741513 0.069825 0.153613 0.143038 0.634413 0.19632 0.026229 0.066035 0.776899 0.111793 0.045273 0.006408 0.091835 0.884015 0.017742 0.013969 0.421618 0.395191 0.169222 0.240519 0.079315 0.553182 0.126985 0.128295 0.189607 0.60613 0.075968 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_71_70_0.551_5.680404e-156 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.006314 0.937893 0.028918 0.026875 0.016901 0.888053 0.028809 0.066237 0.0 0.941344 0.052497 0.006159 0.886776 0.0 0.0 0.113224 0.051939 0.863829 0.051182 0.03305 0.008918 0.699512 0.032894 0.258677 0.027008 0.709141 0.026334 0.237516 0.025142 0.596755 0.347973 0.03013 0.020339 0.055147 0.840006 0.084508 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me2_71_46_0.549_3.386127e-156 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.009829 0.743537 0.105038 0.141595 0.146748 0.670771 0.037204 0.145277 0.007342 0.900112 0.033845 0.058702 0.880378 0.040391 0.004514 0.074718 0.003483 0.812362 0.104142 0.080014 0.104667 0.831409 0.029573 0.034351 0.097374 0.807052 0.070725 0.024848 0.047631 0.667707 0.16717 0.117492 0.009832 0.054106 0.881343 0.054719 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_50_31_0.583_5.632519e-246 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015504 0.836686 0.046229 0.101581 0.015504 0.793969 0.024197 0.166329 0.0 0.937125 0.018698 0.044176 0.831734 0.064242 0.006486 0.097539 0.021937 0.792249 0.089958 0.095855 0.132939 0.777566 0.054262 0.035233 0.02901 0.605138 0.256552 0.1093 0.022394 0.734725 0.141516 0.101365 0.008747 0.049759 0.881163 0.060331 0.019961 0.474587 0.311026 0.194426 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_52_33_0.574_7.777264e-233 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.248776 0.472106 0.22422 0.054898 0.030054 0.755556 0.039906 0.174484 0.019378 0.86927 0.024471 0.086881 0.809543 0.017158 0.019807 0.153492 0.005449 0.959749 0.021269 0.013533 0.110925 0.744002 0.039908 0.105164 0.09403 0.687375 0.201646 0.016948 0.189803 0.584261 0.187688 0.038248 0.037385 0.026249 0.920454 0.015913 0.012381 0.906796 0.043789 0.037035 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_75_40_0.518_1.996114e-75 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.016332 0.917341 0.034229 0.032098 0.019081 0.759127 0.046458 0.175334 0.022525 0.907792 0.042274 0.027409 0.920473 0.01422 0.0 0.065307 0.005423 0.878551 0.094666 0.02136 0.026247 0.785111 0.046082 0.14256 0.018911 0.541015 0.236053 0.20402 0.035982 0.667338 0.250455 0.046224 0.005887 0.0 0.932008 0.062105 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9ac_92_53_0.512_3.590662e-108 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.039291 0.812766 0.049906 0.098038 0.089388 0.742295 0.054941 0.113376 0.019589 0.892077 0.040918 0.047416 0.852143 0.040101 0.0 0.107756 0.007489 0.817433 0.075279 0.099799 0.094625 0.761373 0.024539 0.119463 0.12196 0.654231 0.059087 0.164722 0.040556 0.798768 0.11268 0.047996 0.02504 0.015622 0.868421 0.090916 MOTIF Limb_E12.5_H3K9ac_65_59_0.531_8.225238e-97 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.014958 0.783591 0.152759 0.048692 0.022533 0.88958 0.021319 0.066569 0.049375 0.869392 0.039633 0.041599 0.881312 0.036158 0.0 0.082529 0.035369 0.751809 0.06983 0.142993 0.008724 0.797386 0.033333 0.160557 0.108819 0.654346 0.051617 0.185218 0.029572 0.741749 0.182605 0.046074 0.034458 0.008637 0.895067 0.061839 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_37_33_0.593_1.020935e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.730958 0.242327 0.026715 0.005703 0.967712 0.022 0.004585 0.689044 0.058144 0.055029 0.197783 0.0 0.948628 0.024627 0.026745 0.035774 0.662003 0.037854 0.264369 0.035618 0.761592 0.020003 0.182787 0.011708 0.710367 0.25475 0.023176 0.039494 0.007313 0.9277 0.025493 0.008455 0.951977 0.030668 0.008899 0.155322 0.244512 0.386342 0.213824