MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me1_21_169_0.538_3.042692e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.451 0.064 0.207 0.278 0.082 0.129 0.668 0.121 0.139 0.685 0.029 0.147 0.087 0.076 0.056 0.781 0.005 0.704 0.123 0.168 0.061 0.655 0.018 0.266 0.056 0.83 0.07 0.044 0.182 0.049 0.027 0.742 0.005 0.077 0.912 0.006 0.021 0.842 0.135 0.002 0.646 0.043 0.057 0.254 0.135 0.058 0.756 0.051 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me1_23_166_0.532_1.698559e-59 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.619 0.01 0.251 0.12 0.04 0.052 0.86 0.048 0.068 0.842 0.009 0.081 0.082 0.129 0.021 0.768 0.006 0.527 0.236 0.231 0.044 0.779 0.056 0.121 0.021 0.852 0.073 0.054 0.272 0.114 0.029 0.585 0.016 0.133 0.818 0.033 0.007 0.918 0.031 0.044 0.317 0.019 0.009 0.655 0.035 0.169 0.731 0.065 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me1_20_161_0.529_6.176345e-46 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.069 0.815 0.093 0.023 0.802 0.014 0.087 0.097 0.057 0.056 0.875 0.012 0.017 0.863 0.001 0.119 0.124 0.086 0.011 0.779 0.164 0.061 0.768 0.007 0.083 0.16 0.641 0.116 0.126 0.731 0.074 0.069 0.22 0.001 0.049 0.73 0.069 0.155 0.672 0.104 0.02 0.787 0.117 0.076 0.179 0.183 0.072 0.566 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me1_7_155_0.554_7.782617e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.163 0.244 0.546 0.047 0.097 0.778 0.091 0.034 0.763 0.047 0.049 0.141 0.035 0.065 0.824 0.076 0.069 0.818 0.077 0.036 0.184 0.024 0.046 0.746 0.018 0.031 0.905 0.046 0.057 0.28 0.57 0.093 0.044 0.797 0.122 0.037 0.364 0.046 0.037 0.553 0.05 0.139 0.693 0.118 0.089 0.58 0.258 0.073 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_7_166_0.547_1.244571e-193 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.273 0.214 0.408 0.105 0.106 0.786 0.106 0.002 0.734 0.001 0.045 0.22 0.026 0.001 0.911 0.062 0.071 0.907 0.001 0.021 0.225 0.001 0.001 0.773 0.001 0.001 0.99 0.008 0.083 0.333 0.384 0.2 0.093 0.702 0.078 0.127 0.421 0.012 0.001 0.566 0.035 0.197 0.568 0.2 0.109 0.528 0.188 0.175 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me1_16_161_0.547_2.226859e-165 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.475 0.005 0.25 0.269 0.097 0.114 0.71 0.079 0.018 0.8 0.011 0.171 0.161 0.028 0.019 0.792 0.03 0.013 0.805 0.152 0.136 0.272 0.462 0.131 0.012 0.939 0.03 0.019 0.844 0.013 0.017 0.126 0.036 0.015 0.937 0.012 0.119 0.849 0.011 0.021 0.134 0.01 0.019 0.837 0.014 0.178 0.632 0.176 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me1_11_153_0.554_1.141173e-140 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.442 0.068 0.278 0.211 0.063 0.116 0.671 0.15 0.034 0.931 0.006 0.029 0.13 0.009 0.004 0.857 0.024 0.003 0.913 0.06 0.115 0.216 0.561 0.108 0.032 0.932 0.034 0.002 0.869 0.001 0.009 0.121 0.018 0.003 0.962 0.017 0.088 0.799 0.056 0.057 0.146 0.216 0.073 0.565 0.145 0.176 0.401 0.279 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_16_168_0.541_1.436642e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.167 0.557 0.143 0.133 0.6 0.093 0.101 0.206 0.084 0.036 0.775 0.105 0.068 0.831 0.025 0.076 0.218 0.003 0.002 0.777 0.001 0.053 0.886 0.06 0.181 0.379 0.223 0.217 0.091 0.767 0.063 0.079 0.647 0.01 0.038 0.305 0.1 0.104 0.708 0.088 0.174 0.61 0.078 0.138 0.159 0.196 0.11 0.535 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_16_163_0.545_2.037295e-184 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.602 0.159 0.083 0.156 0.432 0.054 0.396 0.118 0.26 0.555 0.054 0.131 0.294 0.019 0.003 0.684 0.007 0.134 0.828 0.031 0.111 0.529 0.283 0.077 0.037 0.954 0.006 0.003 0.7 0.003 0.03 0.267 0.017 0.004 0.944 0.035 0.053 0.904 0.004 0.039 0.178 0.032 0.019 0.771 0.045 0.108 0.633 0.214