MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_27_165_0.530_3.664744e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068	0.094	0.771	0.067
0.154	0.681	0.057	0.108
0.064	0.037	0.817	0.082
0.785	0.078	0.074	0.063
0.837	0.025	0.062	0.076
0.083	0.042	0.096	0.779
0.834	0.051	0.051	0.064
0.831	0.086	0.027	0.056
0.066	0.047	0.022	0.865
0.061	0.065	0.8	0.074

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_21_154_0.537_4.520912e-124
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.064	0.048	0.06	0.828
0.091	0.058	0.775	0.076
0.141	0.757	0.045	0.057
0.818	0.052	0.059	0.071
0.045	0.025	0.057	0.873
0.107	0.05	0.049	0.794
0.74	0.08	0.094	0.086
0.028	0.069	0.054	0.849
0.049	0.082	0.081	0.788
0.064	0.777	0.063	0.096

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K27ac_39_159_0.542_4.663638e-53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.237	0.458	0.169	0.136
0.191	0.006	0.014	0.789
0.113	0.076	0.651	0.16
0.555	0.216	0.096	0.133
0.621	0.09	0.103	0.186
0.215	0.07	0.105	0.61
0.5	0.109	0.111	0.28
0.609	0.136	0.035	0.22
0.196	0.036	0.036	0.732
0.058	0.1	0.128	0.714
0.181	0.62	0.065	0.134
0.693	0.092	0.005	0.21

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27ac_47_155_0.537_2.652945e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.45	0.206	0.208	0.136
0.192	0.012	0.143	0.653
0.186	0.166	0.483	0.165
0.503	0.322	0.053	0.122
0.589	0.066	0.066	0.279
0.166	0.085	0.119	0.63
0.321	0.091	0.083	0.505
0.545	0.177	0.088	0.19
0.187	0.086	0.078	0.649
0.148	0.077	0.28	0.495
0.1	0.584	0.09	0.226
0.673	0.116	0.01	0.201

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K27ac_16_154_0.559_5.815912e-116
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094	0.169	0.086	0.651
0.059	0.073	0.665	0.203
0.293	0.606	0.059	0.042
0.863	0.012	0.02	0.105
0.044	0.008	0.074	0.874
0.278	0.042	0.021	0.659
0.664	0.04	0.11	0.186
0.274	0.022	0.027	0.677
0.036	0.116	0.296	0.552
0.172	0.596	0.084	0.148

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K27ac_36_154_0.534_1.954455e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.695	0.126	0.088	0.091
0.086	0.036	0.096	0.782
0.075	0.082	0.72	0.123
0.131	0.731	0.076	0.062
0.789	0.075	0.029	0.107
0.082	0.056	0.075	0.787
0.106	0.084	0.072	0.738
0.696	0.087	0.091	0.126
0.091	0.069	0.064	0.776
0.064	0.069	0.092	0.775
0.101	0.706	0.074	0.119
0.806	0.072	0.025	0.097

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K27ac_37_162_0.546_1.030169e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074	0.047	0.056	0.823
0.066	0.073	0.746	0.115
0.155	0.772	0.043	0.03
0.791	0.05	0.067	0.092
0.052	0.016	0.062	0.87
0.111	0.058	0.035	0.796
0.813	0.069	0.056	0.062
0.096	0.04	0.045	0.819
0.046	0.068	0.085	0.801
0.057	0.772	0.076	0.095

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27ac_17_157_0.549_3.372461e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055	0.037	0.056	0.852
0.074	0.083	0.743	0.1
0.115	0.793	0.043	0.049
0.861	0.018	0.029	0.092
0.053	0.033	0.083	0.831
0.128	0.045	0.029	0.798
0.744	0.054	0.109	0.093
0.112	0.04	0.035	0.813
0.043	0.068	0.075	0.814
0.071	0.752	0.059	0.118

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K27ac_19_154_0.559_4.364733e-103
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078	0.063	0.044	0.815
0.051	0.064	0.79	0.095
0.155	0.763	0.034	0.048
0.844	0.032	0.025	0.099
0.043	0.035	0.063	0.859
0.141	0.045	0.046	0.768
0.752	0.053	0.066	0.129
0.077	0.024	0.045	0.854
0.039	0.067	0.091	0.803
0.081	0.752	0.069	0.098

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_71_171_0.555_3.12748e-89
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024	0.038	0.882	0.056
0.124	0.776	0.056	0.044
0.997	0.001	0.001	0.001
0.038	0.001	0.044	0.917
0.062	0.001	0.001	0.936
0.692	0.058	0.15	0.1
0.036	0.001	0.018	0.945
0.023	0.047	0.04	0.89