MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_66_168_0.557_5.110539e-83
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.175	0.434	0.174	0.217
0.208	0.162	0.465	0.165
0.817	0.05	0.08	0.053
0.906	0.015	0.056	0.023
0.782	0.083	0.082	0.053
0.113	0.001	0.058	0.828
0.078	0.066	0.763	0.093
0.095	0.785	0.063	0.057
0.749	0.078	0.003	0.17
0.076	0.077	0.112	0.735
0.054	0.068	0.041	0.837
0.067	0.067	0.075	0.791

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me2_77_174_0.556_1.221091e-78
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.134	0.548	0.159	0.159
0.15	0.12	0.614	0.116
0.796	0.062	0.085	0.057
0.821	0.047	0.084	0.048
0.759	0.088	0.084	0.069
0.098	0.036	0.088	0.778
0.088	0.07	0.761	0.081
0.082	0.763	0.066	0.089
0.764	0.084	0.038	0.114
0.07	0.064	0.094	0.772
0.052	0.075	0.052	0.821
0.062	0.075	0.059	0.804

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_72_164_0.553_1.182538e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.798	0.029	0.101	0.072
0.8	0.121	0.019	0.06
0.819	0.007	0.083	0.091
0.172	0.621	0.1	0.107
0.289	0.002	0.008	0.701
0.107	0.076	0.706	0.111
0.044	0.809	0.093	0.054
0.745	0.116	0.008	0.131
0.08	0.081	0.005	0.834
0.03	0.037	0.027	0.906
0.019	0.166	0.036	0.779
0.13	0.504	0.12	0.246

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_71_174_0.552_6.05931e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.251	0.076	0.594	0.079
0.754	0.077	0.084	0.085
0.806	0.054	0.065	0.075
0.743	0.076	0.091	0.09
0.157	0.66	0.09	0.093
0.158	0.047	0.049	0.746
0.114	0.094	0.695	0.097
0.106	0.685	0.094	0.115
0.495	0.083	0.045	0.377
0.063	0.078	0.14	0.719
0.07	0.085	0.077	0.768
0.065	0.138	0.067	0.73

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_60_174_0.551_1.118324e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.814	0.05	0.083	0.053
0.752	0.074	0.094	0.08
0.104	0.046	0.05	0.8
0.085	0.057	0.802	0.056
0.068	0.774	0.06	0.098
0.793	0.059	0.052	0.096
0.085	0.059	0.758	0.098
0.064	0.065	0.021	0.85
0.025	0.079	0.042	0.854
0.077	0.053	0.064	0.806

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_45_159_0.574_1.646645e-102
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.916	0.021	0.036	0.027
0.939	0.009	0.035	0.017
0.874	0.036	0.036	0.054
0.039	0.031	0.076	0.854
0.06	0.078	0.834	0.028
0.089	0.844	0.034	0.033
0.206	0.567	0.052	0.175
0.126	0.086	0.646	0.142
0.037	0.036	0.043	0.884
0.018	0.027	0.056	0.899
0.027	0.047	0.033	0.893
0.017	0.068	0.064	0.851

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K9ac_62_165_0.564_5.244297e-89
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.743	0.074	0.089	0.094
0.778	0.068	0.085	0.069
0.767	0.075	0.088	0.07
0.724	0.084	0.078	0.114
0.132	0.121	0.082	0.665
0.088	0.059	0.101	0.752
0.087	0.094	0.726	0.093
0.093	0.735	0.084	0.088
0.763	0.087	0.048	0.102
0.078	0.067	0.097	0.758
0.058	0.074	0.063	0.805
0.08	0.074	0.062	0.784

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9ac_58_166_0.558_4.04926e-76
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.779	0.07	0.079	0.072
0.795	0.063	0.076	0.066
0.745	0.082	0.076	0.097
0.111	0.052	0.084	0.753
0.092	0.091	0.721	0.096
0.101	0.717	0.087	0.095
0.737	0.094	0.064	0.105
0.093	0.082	0.08	0.745
0.066	0.065	0.061	0.808
0.066	0.081	0.062	0.791
0.085	0.089	0.086	0.74
0.1	0.672	0.099	0.129

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_48_166_0.563_4.320208e-86
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.264	0.077	0.587	0.072
0.719	0.096	0.114	0.071
0.756	0.077	0.094	0.073
0.556	0.148	0.238	0.058
0.267	0.103	0.224	0.406
0.061	0.203	0.485	0.252
0.232	0.247	0.207	0.313
0.439	0.056	0.171	0.334
0.269	0.165	0.33	0.236
0.086	0.249	0.086	0.579
0.066	0.115	0.09	0.729
0.087	0.066	0.091	0.756

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9ac_42_164_0.581_1.564688e-101
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.496	0.049	0.35	0.104
0.432	0.315	0.063	0.19
0.241	0.297	0.111	0.352
0.073	0.087	0.721	0.119
0.109	0.539	0.133	0.219
0.467	0.168	0.059	0.306
0.215	0.036	0.282	0.467
0.099	0.074	0.034	0.793
0.171	0.156	0.142	0.531
0.17	0.244	0.101	0.485