MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me2_76_165_0.556_8.130443e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27me3_17_166_0.528_2.062046e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.324 0.228 0.228 0.22 0.656 0.124 0.116 0.104 0.676 0.085 0.122 0.117 0.116 0.124 0.646 0.114 0.109 0.129 0.117 0.645 0.102 0.12 0.119 0.659 0.101 0.127 0.113 0.659 0.106 0.133 0.111 0.65 0.106 0.657 0.117 0.12 0.167 0.565 0.105 0.163 0.154 0.142 0.54 0.164 0.324 0.22 0.229 0.227 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me3_56_171_0.580_2.782564e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me2_46_164_0.572_1.158057e-202 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.236 0.074 0.292 0.398 0.224 0.125 0.295 0.356 0.039 0.683 0.106 0.172 0.141 0.129 0.723 0.007 0.286 0.232 0.353 0.129 0.383 0.262 0.007 0.347 0.673 0.067 0.069 0.191 0.609 0.099 0.069 0.223 0.732 0.069 0.038 0.161 0.007 0.724 0.107 0.162 0.163 0.038 0.471 0.328 0.167 0.172 0.237 0.424 MOTIF Liver_E12.5_H3K4me2_25_171_0.583_9.238201e-243 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.081 0.59 0.135 0.194 0.069 0.126 0.677 0.128 0.237 0.183 0.067 0.513 0.18 0.125 0.067 0.628 0.239 0.235 0.067 0.46 0.353 0.125 0.452 0.07 0.069 0.739 0.067 0.125 0.232 0.406 0.292 0.07 0.182 0.068 0.681 0.069 0.181 0.068 0.181 0.57 0.295 0.238 0.182 0.285 0.258 0.076 0.303 0.364 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me2_23_163_0.614_1.423949e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.206 0.22 0.312 0.261 0.234 0.297 0.255 0.214 0.442 0.09 0.215 0.254 0.73 0.173 0.091 0.006 0.078 0.778 0.092 0.052 0.01 0.052 0.926 0.012 0.091 0.377 0.116 0.415 0.174 0.173 0.438 0.215 0.689 0.048 0.132 0.131 0.543 0.09 0.114 0.253 0.334 0.172 0.28 0.214 0.29 0.225 0.223 0.263 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_34_164_0.617_2.114148e-257 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.257 0.255 0.317 0.171 0.243 0.253 0.211 0.294 0.596 0.065 0.128 0.211 0.025 0.885 0.066 0.024 0.003 0.148 0.845 0.004 0.211 0.252 0.285 0.252 0.597 0.127 0.149 0.127 0.515 0.106 0.127 0.252 0.598 0.127 0.086 0.189 0.68 0.086 0.086 0.148 0.232 0.325 0.253 0.19 0.214 0.234 0.358 0.194 MOTIF Heart_E16.5_H3K4me2_19_171_0.597_1.311019e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.268 0.243 0.241 0.248 0.316 0.186 0.238 0.26 0.134 0.389 0.342 0.135 0.007 0.799 0.186 0.008 0.007 0.083 0.826 0.084 0.597 0.186 0.135 0.082 0.34 0.185 0.161 0.315 0.624 0.056 0.109 0.211 0.623 0.134 0.083 0.16 0.161 0.083 0.109 0.647 0.311 0.29 0.187 0.212 0.166 0.294 0.375 0.164 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_12_167_0.644_1.466499e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.273 0.151 0.122 0.454 0.43 0.185 0.237 0.148 0.512 0.103 0.25 0.135 0.182 0.27 0.119 0.43 0.167 0.119 0.247 0.467 0.164 0.136 0.17 0.53 0.168 0.171 0.198 0.464 0.131 0.565 0.185 0.119 0.107 0.639 0.232 0.022 0.021 0.139 0.718 0.122 0.283 0.412 0.136 0.169 0.073 0.218 0.406 0.303 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_32_172_0.673_4.415761e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.202 0.198 0.326 0.274 0.392 0.098 0.409 0.101 0.019 0.967 0.013 0.001 0.003 0.072 0.924 0.001 0.173 0.011 0.684 0.132 0.349 0.375 0.08 0.196 0.768 0.081 0.04 0.111 0.715 0.114 0.038 0.133 0.58 0.005 0.063 0.352 0.006 0.935 0.001 0.058 0.15 0.174 0.526 0.15 0.177 0.119 0.169 0.535