MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_25_4_0.527_4.910226e-153
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020341	0.957028	0.018649	0.003982
0.049702	0.098312	0.103169	0.748816
0.005536	0.918112	0.056262	0.02009
0.017522	0.565285	0.394448	0.022745
0.016083	0.680213	0.296222	0.007482
0.055075	0.903355	0.036517	0.005054
0.022244	0.036774	0.900347	0.040635
0.011513	0.961664	0.008706	0.018116
0.018365	0.9336	0.021236	0.0268

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K27me3_49_34_0.504_3.456947e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053726	0.211724	0.592947	0.141602
0.02499	0.870793	0.064632	0.039585
0.048815	0.032288	0.017415	0.901482
0.017021	0.886438	0.055342	0.041199
0.112491	0.727135	0.027049	0.133325
0.012838	0.844759	0.052052	0.090351
0.268096	0.618999	0.061759	0.051146
0.068242	0.008519	0.849166	0.074073
0.087222	0.669328	0.189382	0.054068
0.081491	0.854154	0.044083	0.020271

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me2_41_28_0.591_2.250469e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014769	0.043381	0.931431	0.010419
0.096529	0.764125	0.014293	0.125052
0.063044	0.033081	0.847783	0.056092
0.016063	0.066913	0.894845	0.022179
0.226141	0.045134	0.570228	0.158497
0.045942	0.05243	0.872331	0.029297
0.865552	0.043891	0.018852	0.071705
0.075868	0.041388	0.833317	0.049427
0.187082	0.695534	0.040682	0.076702
0.090039	0.250878	0.360445	0.298638

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me2_20_21_0.614_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.267009	0.25707	0.316798	0.159123
0.045017	0.0519	0.890838	0.012245
0.00932	0.892331	0.018174	0.080175
0.04931	0.054852	0.848229	0.047608
0.012985	0.027487	0.931121	0.028407
0.275687	0.042532	0.576625	0.105156
0.033503	0.039624	0.902141	0.024732
0.845397	0.020804	0.025008	0.108791
0.09788	0.050986	0.767575	0.08356
0.237661	0.686602	0.055399	0.020337
0.198469	0.318461	0.407647	0.075424

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_30_7_0.597_2.674785e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.057982	0.198775	0.41608	0.327163
0.367272	0.124862	0.383175	0.12469
0.009686	0.781349	0.194829	0.014136
0.032177	0.012058	0.056366	0.8994
0.021881	0.81966	0.107306	0.051153
0.016026	0.878129	0.072064	0.033781
0.070051	0.727096	0.092174	0.110679
0.045152	0.745688	0.160617	0.048543
0.030655	0.02348	0.905708	0.040157
0.00953	0.703154	0.255005	0.032311
0.064548	0.682099	0.06985	0.183502
0.031261	0.01964	0.828656	0.120443
0.030603	0.0	0.266891	0.702506

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me2_43_17_0.589_3.865698e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053339	0.857495	0.06051	0.028656
0.021604	0.037993	0.039665	0.900739
0.029314	0.793174	0.132349	0.045162
0.020323	0.740046	0.121141	0.118489
0.060164	0.847901	0.07475	0.017185
0.175503	0.611553	0.148808	0.064137
0.050362	0.024345	0.823802	0.101491
0.008857	0.840669	0.089218	0.061256
0.105104	0.811508	0.047382	0.036006
0.17373	0.0	0.450246	0.376023

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_72_13_0.566_5.017274e-164
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087588	0.448905	0.143815	0.319692
0.01103	0.918246	0.041908	0.028817
0.040524	0.027143	0.024472	0.907861
0.017199	0.801716	0.131293	0.049793
0.024118	0.782214	0.068153	0.125515
0.047146	0.79652	0.057197	0.099137
0.050898	0.674592	0.13071	0.143801
0.082868	0.059259	0.765764	0.092109
0.011203	0.754944	0.176253	0.057601
0.025058	0.807545	0.064161	0.103236
0.094639	0.0	0.341762	0.563599

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_50_16_0.601_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0255	0.903037	0.040317	0.031146
0.030491	0.015355	0.04562	0.908534
0.015779	0.815232	0.131673	0.037317
0.017246	0.804349	0.060316	0.118089
0.054517	0.794555	0.072134	0.078795
0.044622	0.63443	0.19068	0.130268
0.082302	0.035597	0.834766	0.047335
0.009034	0.756245	0.178358	0.056362
0.111108	0.784078	0.069479	0.035335
0.048091	0.0	0.466511	0.485398

MOTIF	Lung_P0_H3K4me3_56_24_0.602_1.459904e-209
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013499	0.90403	0.049858	0.032612
0.037276	0.033757	0.018028	0.910938
0.035469	0.871738	0.039295	0.053498
0.0189	0.777743	0.041135	0.162222
0.066408	0.745084	0.070176	0.118332
0.154445	0.627469	0.188791	0.029295
0.065908	0.02907	0.755063	0.149959
0.017893	0.899524	0.064911	0.017671
0.136865	0.775198	0.04416	0.043777
0.065165	0.0	0.548145	0.38669

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_42_15_0.631_2.944725e-261
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040114	0.870604	0.050376	0.038906
0.026353	0.008603	0.0391	0.925944
0.02076	0.88684	0.040343	0.052057
0.031853	0.76476	0.080363	0.123024
0.065793	0.754956	0.093606	0.085644
0.133029	0.680039	0.151691	0.035241
0.059405	0.028748	0.784184	0.127663
0.010829	0.786302	0.167774	0.035095
0.043845	0.800936	0.054988	0.100231
0.137845	0.0	0.539448	0.322707