MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_97_58_0.503_3.220788e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.387366	0.135078	0.409573	0.067983
0.056572	0.052368	0.506318	0.384742
0.027532	0.422749	0.380094	0.169624
0.03727	0.404132	0.107841	0.450757
0.027176	0.931734	0.024012	0.017078
0.787714	0.086764	0.006703	0.118819
0.00106	0.94848	0.049939	0.00052
0.805047	0.033086	0.038134	0.123734
0.022734	0.033481	0.90905	0.034735
0.63435	0.150304	0.052945	0.162401
0.113439	0.03272	0.83233	0.021511
0.047503	0.667116	0.205811	0.07957
0.785653	0.125171	0.031669	0.057507

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_53_47_0.523_7.768291e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.11326	0.0	0.88674
0.107569	0.429803	0.382389	0.080239
0.087662	0.570344	0.170471	0.171522
0.040897	0.678212	0.260252	0.020639
0.899066	0.050791	0.033105	0.017038
0.09901	0.863995	0.033604	0.003392
0.940292	0.020636	0.022529	0.016543
0.097957	0.075253	0.823055	0.003735
0.705505	0.174244	0.066456	0.053795
0.054702	0.005152	0.917473	0.022673
0.165212	0.698007	0.050144	0.086638
0.690485	0.053164	0.152987	0.103364
0.00317	0.179623	0.813277	0.00393

MOTIF	Heart_E11.5_H3K27me3_26_141_0.516_2.61778e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.812507	0.0	0.127325	0.060167
0.062161	0.877445	0.017649	0.042745
0.671186	0.201245	0.055617	0.071953
0.056091	0.0	0.943909	0.0
0.861703	0.044935	0.013553	0.079809
0.013749	0.008589	0.976222	0.001441
0.271811	0.704969	0.020831	0.002388
0.866428	0.0	0.032309	0.101262
0.0	0.103514	0.656528	0.239957

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_46_171_0.521_5.827636e-40
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088	0.096	0.071	0.745
0.086	0.098	0.106	0.71
0.09	0.75	0.074	0.086
0.753	0.091	0.061	0.095
0.091	0.74	0.112	0.057
0.787	0.047	0.072	0.094
0.105	0.087	0.753	0.055
0.751	0.077	0.076	0.096
0.088	0.077	0.764	0.071
0.1	0.746	0.091	0.063
0.762	0.076	0.06	0.102
0.082	0.09	0.738	0.09

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me1_53_87_0.539_2.60172e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038806	0.474624	0.314644	0.171927
0.88051	0.037135	0.046944	0.035412
0.055636	0.886877	0.056047	0.00144
0.662376	0.145198	0.030843	0.161582
0.007696	0.19427	0.787133	0.010901
0.676809	0.062912	0.020442	0.239836
0.010137	0.02107	0.950982	0.017811
0.018513	0.889243	0.059602	0.032643
0.712091	0.020882	0.223433	0.043593
0.028896	0.007133	0.939392	0.024578

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_58_65_0.516_3.14604e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.719982	0.087806	0.066436	0.125776
0.06804	0.866465	0.055743	0.009752
0.858015	0.063792	0.02394	0.054253
0.099008	0.142031	0.748466	0.010495
0.795348	0.044471	0.097246	0.062935
0.056762	0.015413	0.915164	0.012661
0.122424	0.791038	0.057572	0.028966
0.729454	0.067846	0.058469	0.14423
0.020728	0.088104	0.856678	0.03449

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me1_65_83_0.508_4.523322e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.808311	0.058807	0.077851	0.05503
0.088895	0.772788	0.119264	0.019053
0.881293	0.060663	0.02624	0.031804
0.093276	0.061957	0.825323	0.019443
0.875	0.061579	0.027806	0.035615
0.1041	0.048512	0.820855	0.026534
0.254389	0.618093	0.096528	0.03099
0.820214	0.019549	0.063689	0.096547
0.019582	0.057978	0.90495	0.017489
0.115841	0.22673	0.538536	0.118893

MOTIF	Heart_E16.5_H3K4me1_46_86_0.515_2.599847e-61
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033734	0.492316	0.370342	0.103608
0.869517	0.049637	0.058951	0.021895
0.093836	0.858997	0.038633	0.008534
0.877999	0.030235	0.010796	0.08097
0.09923	0.217275	0.64437	0.039125
0.758913	0.102014	0.082882	0.056191
0.080628	0.10222	0.783599	0.033552
0.117394	0.765269	0.040618	0.076718
0.824027	0.028978	0.041472	0.105523
0.026911	0.045906	0.879748	0.047435

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_52_36_0.519_4.564513e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044368	0.008334	0.66863	0.278668
0.824805	0.039764	0.088584	0.046847
0.067075	0.862867	0.058154	0.011904
0.854485	0.061763	0.062605	0.021148
0.121726	0.141467	0.729434	0.007373
0.773142	0.1482	0.052536	0.026122
0.039899	0.024417	0.915093	0.020591
0.089923	0.792308	0.054298	0.06347
0.685538	0.134914	0.098138	0.08141
0.041194	0.133437	0.77858	0.046789
0.0	0.297769	0.417593	0.284638

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_103_123_0.501_1.513839e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.483173	0.097996	0.0	0.418831
0.042254	0.584467	0.365813	0.007466
0.936587	0.037977	0.011667	0.013768
0.08255	0.895851	0.018215	0.003384
0.887023	0.027785	0.041255	0.043937
0.138167	0.055966	0.805867	0.0
0.485042	0.212751	0.074602	0.227605
0.024439	0.064297	0.893791	0.017473
0.205396	0.746301	0.042064	0.006239
0.800863	0.030788	0.070958	0.097392
0.0	0.041813	0.893774	0.064414