MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9me3_86_8_0.510_0.0002154376
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.901072	0.002592	0.018914	0.077422
0.023956	0.056217	0.887502	0.032325
0.150838	0.012199	0.082097	0.754865
0.013992	0.014879	0.782225	0.188903
0.039453	0.890501	0.007482	0.062564
0.002481	0.021844	0.022767	0.952908
0.100482	0.702162	0.197356	0.0
0.024093	0.872771	0.089816	0.01332
0.937264	0.03839	0.014761	0.009585
0.242408	0.64607	0.111521	0.0

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9me3_42_9_0.523_8.809143e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.785586	0.047009	0.113159	0.054246
0.018444	0.009375	0.862008	0.110173
0.148608	0.015053	0.089229	0.74711
0.023838	0.053973	0.694178	0.228011
0.017437	0.716701	0.009291	0.25657
0.007114	0.013464	0.019119	0.960302
0.035788	0.892075	0.041314	0.030823
0.012272	0.94527	0.028282	0.014175
0.92599	0.067643	0.004713	0.001653
0.095256	0.258233	0.069833	0.576679

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9me3_97_8_0.506_0.001553898
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.972723	0.002187	0.02509
0.980585	0.000461	0.004102	0.014852
0.034672	0.019295	0.830085	0.115947
0.058047	0.002272	0.070532	0.869149
0.144548	0.035647	0.70794	0.111865
0.062926	0.805556	0.012131	0.119386
0.003147	0.029144	0.0	0.967709
0.18708	0.786703	0.019778	0.006438
0.139931	0.787836	0.03301	0.039223

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9me3_99_6_0.507_2.799211e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.225443	0.239091	0.19635	0.339116
0.010089	0.946043	0.023043	0.020825
0.870946	0.024651	0.041572	0.062832
0.015704	0.020476	0.884067	0.079754
0.201338	0.044209	0.115443	0.63901
0.07163	0.157979	0.65707	0.113321
0.078005	0.723931	0.030411	0.167653
0.0119	0.023145	0.001842	0.963114
0.014409	0.829174	0.027387	0.12903
0.120033	0.837763	0.004389	0.037816

MOTIF	Limb_E15.5_H3K9me3_69_21_0.511_0.001376373
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049306	0.876624	0.030468	0.043602
0.782613	0.051773	0.025659	0.139955
0.049409	0.109574	0.812333	0.028684
0.124991	0.014433	0.045158	0.815418
0.044977	0.104171	0.813191	0.037661
0.068879	0.846023	0.041385	0.043712
0.028121	0.056169	0.041857	0.873853
0.069809	0.768079	0.05324	0.108872
0.088383	0.806416	0.025679	0.079522
0.436608	0.353691	0.154688	0.055013

MOTIF	Liver_E11.5_H3K9me3_50_2_0.519_3.052597e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031598	0.934293	0.005729	0.02838
0.829525	0.061783	0.042564	0.066129
0.062242	0.097617	0.816943	0.023199
0.045348	0.029741	0.043451	0.88146
0.030856	0.034798	0.823194	0.111152
0.03582	0.880486	0.035316	0.048378
0.037561	0.082167	0.01157	0.868703
0.10246	0.684309	0.170307	0.042924
0.0606	0.762208	0.053556	0.123635
0.48451	0.366192	0.078851	0.070448
0.248306	0.408379	0.101235	0.242079

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9me3_95_17_0.506_1.619451e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020583	0.904157	0.057431	0.017828
0.820332	0.020667	0.045571	0.113431
0.038589	0.129109	0.80577	0.026532
0.134922	0.019734	0.040469	0.804875
0.086974	0.084824	0.751585	0.076617
0.066869	0.775625	0.040003	0.117503
0.081209	0.037311	0.011435	0.870045
0.046815	0.80503	0.115766	0.032389
0.02852	0.817596	0.027141	0.126743
0.673972	0.168991	0.049583	0.107455

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9me3_31_2_0.524_0.002831865
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043098	0.852836	0.04928	0.054786
0.835653	0.079743	0.033129	0.051475
0.086669	0.109091	0.752842	0.051398
0.07012	0.05121	0.030861	0.847809
0.055762	0.126542	0.730223	0.087472
0.070291	0.823061	0.009405	0.097242
0.008947	0.070392	0.026038	0.894623
0.085188	0.837737	0.048787	0.028288
0.064679	0.875043	0.017719	0.042559
0.654849	0.068843	0.031455	0.244853

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9me3_19_31_0.522_9.835109e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.662592	0.101831	0.072214	0.163363
0.081521	0.10386	0.761536	0.053083
0.073616	0.061491	0.083138	0.781754
0.041205	0.078033	0.786323	0.094439
0.006122	0.890107	0.015402	0.088369
0.066741	0.036473	0.030814	0.865973
0.0813	0.849265	0.044047	0.025388
0.037919	0.897975	0.028846	0.035259
0.862643	0.07252	0.030241	0.034596

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_40_179_0.512_9.970501e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046	0.049	0.021	0.884
0.101	0.04	0.818	0.041
0.063	0.05	0.763	0.124
0.878	0.005	0.059	0.058
0.038	0.041	0.874	0.047
0.086	0.8	0.051	0.063
0.825	0.067	0.021	0.087
0.075	0.744	0.111	0.07
0.075	0.023	0.042	0.86
0.043	0.053	0.849	0.055
0.05	0.061	0.001	0.888
0.04	0.057	0.825	0.078

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_50_176_0.515_0.0002496527
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.184	0.814	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.001	0.997
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001