MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_45_168_0.637_1.215833e-214
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_65_171_0.590_5.182603e-122
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.63	0.117	0.124	0.129
0.118	0.626	0.124	0.132
0.101	0.105	0.087	0.707
0.09	0.104	0.111	0.695
0.091	0.111	0.105	0.693
0.094	0.114	0.106	0.686
0.09	0.118	0.099	0.693
0.089	0.117	0.089	0.705
0.096	0.118	0.097	0.689
0.103	0.672	0.099	0.126
0.146	0.612	0.097	0.145
0.136	0.134	0.592	0.138

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_46_166_0.624_1.259188e-254
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.067	0.137	0.079	0.717
0.049	0.055	0.023	0.873
0.045	0.075	0.202	0.678
0.094	0.075	0.066	0.765
0.054	0.314	0.109	0.523
0.101	0.324	0.071	0.504
0.339	0.178	0.161	0.322
0.26	0.367	0.155	0.217
0.091	0.697	0.075	0.137
0.066	0.207	0.551	0.176

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_23_160_0.677_7.369562e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.075	0.055	0.041	0.829
0.038	0.069	0.052	0.841
0.043	0.083	0.062	0.812
0.04	0.108	0.042	0.81
0.075	0.8	0.051	0.074
0.055	0.128	0.702	0.115
0.053	0.819	0.072	0.056
0.075	0.763	0.061	0.101
0.052	0.09	0.811	0.047
0.069	0.813	0.041	0.077

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me3_35_161_0.643_4.569606e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053	0.067	0.05	0.83
0.081	0.044	0.026	0.849
0.035	0.07	0.036	0.859
0.064	0.088	0.074	0.774
0.063	0.086	0.039	0.812
0.05	0.819	0.034	0.097
0.074	0.144	0.67	0.112
0.041	0.805	0.061	0.093
0.067	0.817	0.045	0.071
0.051	0.13	0.766	0.053

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_48_174_0.621_5.422568e-283
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063	0.031	0.049	0.857
0.083	0.744	0.072	0.101
0.077	0.047	0.81	0.066
0.049	0.078	0.78	0.093
0.086	0.755	0.074	0.085
0.074	0.049	0.771	0.106
0.831	0.048	0.06	0.061
0.81	0.06	0.072	0.058
0.803	0.055	0.076	0.066
0.839	0.03	0.065	0.066

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me3_32_166_0.647_4.334487e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133	0.162	0.14	0.565
0.129	0.623	0.125	0.123
0.132	0.142	0.602	0.124
0.137	0.143	0.588	0.132
0.161	0.573	0.129	0.137
0.148	0.127	0.59	0.135
0.599	0.122	0.161	0.118
0.621	0.12	0.124	0.135
0.642	0.121	0.116	0.121
0.598	0.137	0.124	0.141

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me3_19_158_0.693_1.78483e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081	0.155	0.171	0.593
0.155	0.112	0.083	0.65
0.044	0.163	0.13	0.663
0.079	0.157	0.133	0.631
0.128	0.19	0.12	0.562
0.14	0.617	0.082	0.161
0.153	0.14	0.545	0.162
0.108	0.599	0.163	0.13
0.154	0.545	0.173	0.128
0.127	0.142	0.593	0.138

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_20_159_0.725_6.743343e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.165	0.152	0.12	0.563
0.12	0.129	0.131	0.62
0.096	0.127	0.074	0.703
0.093	0.164	0.085	0.658
0.107	0.23	0.161	0.502
0.123	0.603	0.066	0.208
0.117	0.139	0.587	0.157
0.102	0.551	0.195	0.152
0.155	0.54	0.218	0.087
0.085	0.122	0.677	0.116

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_18_159_0.715_4.524267e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.134	0.14	0.129	0.597
0.125	0.129	0.131	0.615
0.134	0.135	0.119	0.612
0.119	0.143	0.129	0.609
0.122	0.158	0.147	0.573
0.13	0.61	0.111	0.149
0.129	0.136	0.594	0.141
0.125	0.587	0.147	0.141
0.134	0.583	0.157	0.126
0.126	0.131	0.619	0.124

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9ac_40_168_0.590_1.873034e-151
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047	0.082	0.083	0.788
0.08	0.035	0.083	0.802
0.047	0.104	0.051	0.798
0.023	0.063	0.118	0.796
0.06	0.095	0.09	0.755
0.078	0.066	0.067	0.789
0.087	0.738	0.024	0.151
0.088	0.083	0.765	0.064
0.05	0.742	0.09	0.118
0.054	0.882	0.012	0.052