MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me1_4_155_0.546_2.1955e-185 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.224 0.364 0.117 0.295 0.175 0.042 0.031 0.752 0.077 0.073 0.467 0.382 0.214 0.138 0.129 0.519 0.355 0.383 0.049 0.212 0.759 0.047 0.057 0.137 0.409 0.052 0.352 0.187 0.096 0.739 0.075 0.09 0.716 0.03 0.042 0.212 0.067 0.399 0.474 0.059 0.275 0.267 0.057 0.401 0.195 0.254 0.266 0.284 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me1_71_160_0.517_5.928815e-19 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.633 0.115 0.117 0.135 0.119 0.113 0.115 0.653 0.11 0.104 0.11 0.676 0.106 0.105 0.1 0.689 0.122 0.119 0.105 0.654 0.693 0.071 0.11 0.126 0.128 0.111 0.637 0.124 0.12 0.652 0.105 0.123 0.728 0.071 0.071 0.13 0.116 0.119 0.638 0.127 0.104 0.11 0.101 0.685 0.118 0.109 0.112 0.661 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_18_162_0.534_1.090716e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me1_14_160_0.541_5.94711e-137 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.463 0.078 0.112 0.347 0.132 0.104 0.638 0.126 0.333 0.11 0.445 0.112 0.112 0.668 0.123 0.097 0.414 0.07 0.075 0.442 0.118 0.111 0.647 0.124 0.17 0.345 0.072 0.413 0.111 0.103 0.098 0.688 0.128 0.102 0.116 0.654 0.659 0.108 0.11 0.123 0.675 0.107 0.103 0.115 0.382 0.085 0.162 0.371 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_4_153_0.563_2.681085e-165 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.561 0.044 0.167 0.228 0.194 0.046 0.144 0.616 0.182 0.137 0.055 0.626 0.685 0.062 0.019 0.234 0.716 0.223 0.058 0.003 0.486 0.124 0.165 0.225 0.196 0.628 0.171 0.005 0.48 0.163 0.2 0.157 0.009 0.205 0.748 0.038 0.137 0.572 0.174 0.117 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K27ac_29_154_0.538_9.535858e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085 0.75 0.082 0.083 0.106 0.025 0.038 0.831 0.079 0.103 0.739 0.079 0.692 0.125 0.073 0.11 0.099 0.082 0.08 0.739 0.082 0.074 0.086 0.758 0.747 0.077 0.078 0.098 0.782 0.068 0.054 0.096 0.099 0.109 0.065 0.727 0.084 0.038 0.109 0.769 0.084 0.096 0.714 0.106 0.077 0.752 0.072 0.099 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K27ac_12_152_0.565_2.564571e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.051 0.101 0.7 0.148 0.046 0.872 0.078 0.004 0.269 0.001 0.001 0.729 0.152 0.16 0.557 0.131 0.584 0.079 0.054 0.283 0.047 0.001 0.015 0.937 0.082 0.001 0.178 0.739 0.904 0.033 0.04 0.023 0.921 0.001 0.001 0.077 0.224 0.001 0.001 0.774 0.137 0.132 0.21 0.521 0.543 0.157 0.052 0.248 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27ac_18_153_0.559_2.174932e-116 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.469 0.228 0.095 0.208 0.519 0.001 0.021 0.459 0.168 0.001 0.018 0.813 0.283 0.061 0.156 0.499 0.529 0.269 0.009 0.193 0.614 0.107 0.017 0.262 0.301 0.048 0.228 0.423 0.135 0.46 0.208 0.198 0.617 0.001 0.001 0.381 0.025 0.171 0.626 0.178 0.214 0.505 0.165 0.116 0.359 0.345 0.001 0.295 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K27ac_33_153_0.548_1.56459e-28 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.158 0.029 0.546 0.267 0.07 0.217 0.55 0.163 0.132 0.615 0.216 0.037 0.204 0.066 0.064 0.666 0.163 0.213 0.509 0.115 0.446 0.186 0.081 0.287 0.17 0.084 0.064 0.682 0.076 0.032 0.205 0.687 0.474 0.191 0.12 0.216 0.694 0.059 0.064 0.183 0.179 0.036 0.054 0.731 0.087 0.128 0.228 0.557 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K9ac_55_158_0.555_1.602173e-82 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.711 0.095 0.095 0.099 0.64 0.081 0.081 0.198 0.208 0.058 0.083 0.651 0.146 0.086 0.224 0.544 0.724 0.114 0.067 0.095 0.768 0.106 0.051 0.075 0.546 0.003 0.006 0.445 0.137 0.074 0.326 0.463 0.085 0.744 0.068 0.103 0.7 0.044 0.01 0.246 0.089 0.092 0.729 0.09 0.181 0.65 0.077 0.092 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K9ac_65_173_0.560_6.102275e-75 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.753 0.09 0.059 0.098 0.669 0.059 0.04 0.232 0.153 0.057 0.068 0.722 0.179 0.107 0.093 0.621 0.734 0.102 0.055 0.109 0.841 0.054 0.051 0.054 0.308 0.032 0.252 0.408 0.107 0.769 0.09 0.034 0.885 0.004 0.001 0.11 0.032 0.03 0.907 0.031 0.155 0.71 0.091 0.044 0.349 0.328 0.094 0.23