MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E13.5_H3K27ac_29_18_0.540_5.108926e-119
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.261065	0.500228	0.238707	0.0
0.0	0.972954	0.027046	0.0
0.022228	0.0	0.93533	0.042442
0.017126	0.925286	0.0553	0.002288
0.0509	0.879437	0.031086	0.038578
0.0	0.839094	0.160906	0.0
0.012276	0.065456	0.871774	0.050494
0.228504	0.0	0.760832	0.010664
0.306293	0.465837	0.0	0.227871
0.033226	0.966774	0.0	0.0

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_38_24_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.090176	0.734218	0.091065	0.084541
0.18377	0.713489	0.002373	0.100368
0.160754	0.040772	0.737234	0.061241
0.03769	0.895437	0.06205	0.004823
0.017776	0.696535	0.087541	0.198148
0.172841	0.688501	0.037603	0.101054
0.02851	0.0	0.942904	0.028586
0.006199	0.031523	0.943225	0.019053
0.040373	0.810751	0.122523	0.026354

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_34_24_0.607_4.40756e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0514	0.820486	0.059471	0.068643
0.019409	0.887872	0.043988	0.048731
0.158134	0.0328	0.480245	0.328821
0.072507	0.812724	0.04301	0.071759
0.01301	0.755123	0.049263	0.182604
0.061281	0.876888	0.047538	0.014293
0.04372	0.028766	0.7753	0.152213
0.013969	0.0218	0.937895	0.026335
0.027674	0.889788	0.062849	0.019689

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_41_16_0.594_4.604692e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026321	0.884296	0.078127	0.011255
0.026488	0.902057	0.03352	0.037935
0.178036	0.080208	0.714738	0.027018
0.168911	0.027077	0.783225	0.020787
0.03145	0.031847	0.916673	0.020029
0.067838	0.740973	0.037523	0.153666
0.144111	0.033759	0.65335	0.16878
0.089569	0.167414	0.715457	0.02756
0.034122	0.930686	0.023777	0.011415
0.317365	0.148197	0.0	0.534439

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_34_12_0.598_4.589812e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.016632	0.934328	0.025144	0.023897
0.049412	0.861063	0.036058	0.053467
0.050777	0.065142	0.743647	0.140433
0.099964	0.057814	0.759791	0.082432
0.050909	0.070768	0.851265	0.027057
0.186087	0.622856	0.011057	0.18
0.022174	0.026057	0.901186	0.050583
0.070269	0.112586	0.682223	0.134923
0.052608	0.896939	0.029416	0.021037

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me2_35_8_0.611_2.421659e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03281	0.875145	0.068374	0.023671
0.035161	0.856568	0.037539	0.070732
0.108551	0.096539	0.703823	0.091087
0.095473	0.052762	0.786073	0.065691
0.037858	0.038141	0.899885	0.024116
0.153876	0.750502	0.02602	0.069602
0.100247	0.048378	0.741633	0.109742
0.064393	0.152522	0.688738	0.094347
0.022315	0.863417	0.060995	0.053273
0.156218	0.51384	0.057037	0.272904
0.100571	0.690763	0.16051	0.048156

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_28_14_0.593_3.029611e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047364	0.935005	0.007561	0.01007
0.049673	0.868664	0.033506	0.048158
0.047062	0.066414	0.737861	0.148663
0.093568	0.047607	0.813797	0.045028
0.052111	0.026673	0.897687	0.023529
0.224304	0.717866	0.025754	0.032075
0.170635	0.051706	0.713831	0.063828
0.071502	0.119551	0.717901	0.091046
0.027052	0.874275	0.032744	0.065929

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me2_27_13_0.619_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023191	0.878531	0.062439	0.035838
0.037438	0.846464	0.04168	0.074418
0.024068	0.07368	0.791164	0.111088
0.123599	0.067801	0.73746	0.071139
0.04005	0.024245	0.903131	0.032575
0.201249	0.730338	0.039418	0.028996
0.18502	0.08296	0.662681	0.069339
0.069731	0.111772	0.744586	0.073911
0.019774	0.873251	0.033371	0.073605

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_30_15_0.608_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015711	0.964558	0.002051	0.01768
0.06548	0.820582	0.051904	0.062034
0.114939	0.069248	0.743496	0.072317
0.097958	0.03841	0.824239	0.039393
0.030702	0.054715	0.896507	0.018076
0.143925	0.75838	0.018621	0.079074
0.143092	0.053448	0.602401	0.20106
0.054835	0.126974	0.743534	0.074657
0.042105	0.894161	0.026014	0.037721

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_33_27_0.630_1.794603e-287
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.026498	0.931859	0.0	0.041643
0.032176	0.028398	0.427915	0.511511
0.002294	0.966884	0.009628	0.021194
0.010195	0.932496	0.014616	0.042693
0.040826	0.666164	0.259464	0.033546
0.068131	0.016118	0.859396	0.056355
0.013999	0.0	0.903483	0.082518
0.063849	0.760821	0.145699	0.029631
0.080627	0.820983	0.070095	0.028294

MOTIF	Kidney_P0_H3K9ac_34_27_0.596_2.635976e-308
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023793	0.815623	0.015571	0.145013
0.045862	0.84315	0.056795	0.054193
0.15937	0.018901	0.570552	0.251177
0.032855	0.841973	0.057842	0.067331
0.016732	0.773245	0.039471	0.170552
0.069162	0.82205	0.054535	0.054253
0.063698	0.032927	0.710114	0.193261
0.019002	0.03883	0.865048	0.07712
0.037541	0.924307	0.019809	0.018343